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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2l1q | ||||||
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タイトル | Solution structure of human Liver Expressed Antimicrobial Peptide 2 | ||||||
![]() | Liver-expressed antimicrobial peptide 2 | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / polypeptide / disulfides / LEAP-2 | ||||||
機能・相同性 | ![]() antimicrobial humoral response / Antimicrobial peptides / defense response to fungus / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / defense response to bacterium / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Clark, R.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural and functional analysis of human liver-expressed antimicrobial peptide 2. 著者: Henriques, S.T. / Tan, C.C. / Craik, D.J. / Clark, R.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 248.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 213 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 336.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 423 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4593.370 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 1 mM leap2-1, 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 1 mM / 構成要素: leap2-1 |
試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 3.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: Structures were calculated using torsion angle dynamics and subsequently refined by cartesian coordinate dynamics and powell minimization in explicit solvent using CNS. | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |