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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kwx | ||||||
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タイトル | The V27A mutant of influenza A M2 proton channel | ||||||
![]() | Matrix protein 2 | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / M2 proton channel / influenza A / V27A resistant mutant | ||||||
機能・相同性 | ![]() suppression by virus of host autophagy / : / : / proton transmembrane transporter activity / protein complex oligomerization / monoatomic ion channel activity / membrane => GO:0016020 / host cell plasma membrane / virion membrane / membrane / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing, molecular dynamics | ||||||
Model details | lowest energy, model 1 | ||||||
![]() | Pielak, R.M. / Chou, J.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution NMR structure of the V27A drug resistant mutant of influenza A M2 channel. 著者: Pielak, R.M. / Chou, J.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 741.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 627.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 372.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 698.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 40.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 58.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4420.292 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 23-60, proton conducting domain / 変異: V27A, C50S / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: A/UDORN/307/1972 H3N2 / 遺伝子: M / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR 詳細: Solution NMR structure of residues 18-60 of the V27A drug-resistant mutant of influenza A M2 proton channel, determined in DHPC micelles at pH 7.5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing, molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: Standard simulated annealing protocol with cooling from 1000K to 20K, 6.7 ps of Verlet dynamics at each temperature step, using a time step of 3 fs | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 75 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |