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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kjf | ||||||
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タイトル | The solution structure of the circular bacteriocin carnocyclin A (CclA) | ||||||
![]() | Carnocyclin-A | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / circular bacteriocin / antimicrobial peptide / helical / saposin-fold / Antibiotic / Antimicrobial / Bacteriocin | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Martin-Visscher, L.A. / Gong, X. / Duszyk, M. / Vederas, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The three-dimensional structure of carnocyclin A reveals that many circular bacteriocins share a common structural motif. 著者: Martin-Visscher, L.A. / Gong, X. / Duszyk, M. / Vederas, J.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 388.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 340.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 333.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 444.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 29.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 5885.010 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 株: UAL307 / 参照: UniProt: B2MVM5 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | pH: 5.9 / 圧: ambient / 温度: 300 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 657 / NOE intraresidue total count: 209 / NOE long range total count: 125 / NOE medium range total count: 144 / NOE sequential total count: 179 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |