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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2k94 | ||||||
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タイトル | Structural modification of acyl carrier protein by butyryl group | ||||||
要素 | Acyl carrier protein | ||||||
キーワード | LIPID TRANSPORT / Butytyl Form of Acyl Carrier Protein / Fatty Acid Synthesis Protein / Cytoplasm / Fatty acid biosynthesis / Lipid synthesis / Phosphopantetheine | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 lipid biosynthetic process / lipid A biosynthetic process / phosphopantetheine binding / acyl binding / acyl carrier activity / fatty acid biosynthetic process / response to xenobiotic stimulus / lipid binding / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
データ登録者 | Wu, B.N. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2009 タイトル: Structural modification of acyl carrier protein by butyryl group. 著者: Wu, B.N. / Zhang, Y.M. / Rock, C.O. / Zheng, J.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2k94.cif.gz | 467.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2k94.ent.gz | 383.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2k94.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2k94_validation.pdf.gz | 339.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2k94_full_validation.pdf.gz | 556.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2k94_validation.xml.gz | 76.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2k94_validation.cif.gz | 93.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k9/2k94 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k9/2k94 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8513.279 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: butyryl form / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 遺伝子: acpP, b1094, JW1080 / プラスミド: pET11a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P0A6A8 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Butyryl ACP, 40 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | pH: 6.5 / Temperature units: K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |