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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2k31 | ||||||
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タイトル | Solution Structure of cGMP-binding GAF domain of Phosphodiesterase 5 | ||||||
要素 | Phosphodiesterase 5A, cGMP-specific | ||||||
キーワード | HYDROLASE / cyclic nucleotide phosphodiesterase / PDE5 / GAF domain / cGMP | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 cGMP effects / cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity / cGMP metabolic process / positive regulation of oocyte development / positive regulation of chronic inflammatory response / 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase / regulation of nitric oxide mediated signal transduction / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of the force of heart contraction / positive regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway ...cGMP effects / cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity / cGMP metabolic process / positive regulation of oocyte development / positive regulation of chronic inflammatory response / 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase / regulation of nitric oxide mediated signal transduction / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of the force of heart contraction / positive regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway / short-term memory / relaxation of cardiac muscle / positive regulation of cardiac muscle hypertrophy / cGMP catabolic process / 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity / cGMP binding / 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity / negative regulation of T cell proliferation / positive regulation of vasoconstriction / positive regulation of MAP kinase activity / positive regulation of apoptotic process / signal transduction / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Heikaus, C.C. / Stout, J.R. / Sekharan, M.R. / Eakin, C.M. / Rajagopal, P. / Brzovic, P.S. / Beavo, J.A. / Klevit, R.E. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2008 タイトル: Solution Structure of the cGMP Binding GAF Domain from Phosphodiesterase 5: Insights into Nucleotide Selectivity, Dimerization, and cGMP-Dependent Conformational Change. 著者: Heikaus, C.C. / Stout, J.R. / Sekharan, M.R. / Eakin, C.M. / Rajagopal, P. / Brzovic, P.S. / Beavo, J.A. / Klevit, R.E. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR | ||||||
Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2k31.cif.gz | 1 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2k31.ent.gz | 890.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2k31.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k3/2k31 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k3/2k31 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19968.471 Da / 分子数: 1 / 断片: CGMP-BINDING GAF DOMAIN (UNP residues 154-320) / 変異: A295E, I302E / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Pde5a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)star 参照: UniProt: Q0VBW0, UniProt: Q8CG03*PLUS, 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase |
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#2: 化合物 | ChemComp-35G / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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