分子量: 3047.586 Da / 分子数: 1 / 断片: Relaxin-3 B chain / 由来タイプ: 合成 詳細: Peptide chain was assembled by solid phase peptide synthesis. 参照: UniProt: Q8WXF3
#2: タンパク質・ペプチド
Insulin-likepeptideINSL5 / Insulin-like peptide 5
分子量: 2202.509 Da / 分子数: 1 / 断片: Insulin-like peptide INSL5 A chain / 由来タイプ: 合成 詳細: Peptide chain was assembled by solid phase peptide synthesis. 参照: UniProt: Q9Y5Q6
-
実験情報
-
実験
実験
手法: 溶液NMR 詳細: Solution structure of the relaxin-3 B-chain / INSL5 A-chain chimeric peptide.
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
2D 1H-1H TOCSY
1
2
1
2D DQF-COSY
1
3
1
2D 1H-1H NOESY
1
4
2
2D 1H-1H TOCSY
1
5
2
2D 1H-1H NOESY
-
試料調製
詳細
Solution-ID
内容
溶媒系
1
1 mM relaxin-3 B-chain, 1 mM INSL5 A-chain, 90% H2O/10% D2O
90% H2O/10% D2O
2
1 mM relaxin-3 B-chain, 1 mM INSL5 A-chain, 100% D2O
100% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Solution-ID
1mM
relaxin-3 B-chain
1
1mM
INSL5 A-chain
1
1mM
relaxin-3 B-chain
2
1mM
INSL5 A-chain
2
試料状態
イオン強度: 0 / pH: 4 / 圧: ambient / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
TopSpin
1
BrukerBiospin
collection
TopSpin
1
BrukerBiospin
解析
XEASY
Bartelsetal.
chemicalshiftassignment
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
CNS
1.2
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: The structures were generated using torsion angle dynamics in CNS and subsequently refined and energy minimized in a water shell using cartesian dynamics in CNS.
NMR constraints
NOE constraints total: 522 / NOE intraresidue total count: 0 / NOE long range total count: 243 / NOE medium range total count: 32 / NOE sequential total count: 247 / Hydrogen bond constraints total count: 20
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / Maximum upper distance constraint violation: 0.29 Å