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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2jtd | ||||||
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タイトル | Skelemin Immunoglobulin C2 like domain 4 | ||||||
![]() | Myomesin-1 | ||||||
![]() | CELL ADHESION / Skelemin / Immunoglobulin domain / Muscle protein / Thick filament / IMMUNE SYSTEM | ||||||
機能・相同性 | ![]() extraocular skeletal muscle development / protein kinase A signaling / myosin filament / M band / muscle contraction / sarcomere / positive regulation of protein secretion / structural constituent of cytoskeleton / kinase binding / cytoskeleton ...extraocular skeletal muscle development / protein kinase A signaling / myosin filament / M band / muscle contraction / sarcomere / positive regulation of protein secretion / structural constituent of cytoskeleton / kinase binding / cytoskeleton / positive regulation of gene expression / protein homodimerization activity 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / Refinement in Explicit Solvent | ||||||
![]() | Deshmukh, L. / Vinogradova, O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural insight into the interaction between platelet integrin alphaIIbbeta3 and cytoskeletal protein skelemin. 著者: Deshmukh, L. / Tyukhtenko, S. / Liu, J. / Fox, J.E. / Qin, J. / Vinogradova, O. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 899.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 759.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 343.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 480.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 37.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 62.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16397.605 Da / 分子数: 1 / 断片: residues:1207-1328 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 2.7 mM potassium chloride, 140 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | |||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 1 / pH: 7.2 / 圧: ambient / 温度: 313 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Refinement in Explicit Solvent / ソフトェア番号: 1 詳細: Linge et al,Proteins:Structure, Function and Genetics 50:496-506(2003) | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 60 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |