1.38 mM [U-100% 13C, U-100% 15N] StR109 subunit, 100 mM sodium chloride, 100 mM DTT, 5 mM CaCl2, 20 mM MES, 0.02 % sodium azide, 95% H2O, 5% D2O
95% H2O/5% D2O
2
1.8 mM [U-5% 13C, U-100% 15N] StR109 subunit, 100 mM sodium chloride, 100 mM DTT, 5 mM CaCl2, 20 mM MES, 0.02 % sodium azide, 95% H2O, 5% D2O
95% H2O/5% D2O
3
1.2 mM [U-100% 13C, U-100% 15N] / nat. ab. mixture StR109 subunit, 100 mM sodium chloride, 100 mM DTT, 5 mM CaCl2, 20 mM MES, 0.02 % sodium azide, 95% H2O, 5% D2O
95% H2O/5% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
1.38mM
StR109subunit
[U-100% 13C; U-100% 15N]
1
100mM
sodiumchloride
1
100mM
DTT
1
5mM
CaCl2
1
20mM
MES
1
0.02 %
sodiumazide
1
1.8mM
StR109subunit
[U-5% 13C; U-100% 15N]
2
100mM
sodiumchloride
2
100mM
DTT
2
5mM
CaCl2
2
20mM
MES
2
0.02 %
sodiumazide
2
1.2mM
StR109subunit
[U-100% 13C; U-100% 15N] / nat. ab. mixture
3
100mM
sodiumchloride
3
100mM
DTT
3
5mM
CaCl2
3
20mM
MES
3
0.02 %
sodiumazide
3
試料状態
イオン強度: 115 / pH: 6.5 / 圧: AMBIENT / 温度: 298.15 K
-
NMR測定
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
相対比: 1
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian INOVA
Varian
INOVA
600
1
Varian INOVA
Varian
INOVA
750
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
精密化
VNMR
6.1C
Varian
collection
XEASY
1.3.13
Bartels, Guntert, BilleterandWuthrich
データ解析
AutoAssign
1.15.1
Zimmerman, Moseley, Kulikowski, Montelione
chemicalshiftassignment
CARA
1.5.5
KellerandWuthrich
データ解析
PROSA
6.0.2
Guntert
解析
CNS
1.1
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
CNS
1.1
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
構造決定
精密化
手法: TORSION ANGLE DYNAMICS, explicit water bath refinement ソフトェア番号: 1
NMR constraints
Protein chi angle constraints total count: 0 / Protein other angle constraints total count: 0 / Protein phi angle constraints total count: 99 / Protein psi angle constraints total count: 99
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20