登録情報 | データベース: PDB / ID: 2i0d |
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タイトル | Crystal structure of AD-81 complexed with wild type HIV-1 protease |
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要素 | Protease |
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キーワード | HYDROLASE / Drug design / HIv-1 protease / protease inhibitors |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
RNA-directed DNA polymerase activity / aspartic-type endopeptidase activity / proteolysis類似検索 - 分子機能 Retropepsin-like catalytic domain / Retropepsins / Retroviral aspartyl protease / Aspartyl protease, retroviral-type family profile. / Peptidase A2A, retrovirus, catalytic / Cathepsin D, subunit A; domain 1 / Acid Proteases / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. / Aspartic peptidase domain superfamily ...Retropepsin-like catalytic domain / Retropepsins / Retroviral aspartyl protease / Aspartyl protease, retroviral-type family profile. / Peptidase A2A, retrovirus, catalytic / Cathepsin D, subunit A; domain 1 / Acid Proteases / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. / Aspartic peptidase domain superfamily / Beta Barrel / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / Chem-MUT / PHOSPHATE ION / Protease / Protease類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_virus.gif) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.95 Å |
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データ登録者 | Nalam, M.N.L. / Schiffer, C.A. / Ali, A. / Reddy, K.K. / Cao, H. / Anjum, S.G. / Rana, T.M. |
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引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2006 タイトル: Discovery of HIV-1 Protease Inhibitors with Picomolar Affinities Incorporating N-Aryl-oxazolidinone-5-carboxamides as Novel P2 Ligands. 著者: Ali, A. / Reddy, G.S. / Cao, H. / Anjum, S.G. / Nalam, M.N. / Schiffer, C.A. / Rana, T.M. |
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履歴 | 登録 | 2006年8月10日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2006年12月19日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年5月1日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Advisory / Refinement description / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月18日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.4 | 2021年10月20日 | Group: Database references / Derived calculations / カテゴリ: database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.5 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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