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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2het | ||||||
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タイトル | Non-myristoylated bovine recoverin (truncated at C-terminus) with calcium bound to EF-hand 3 | ||||||
![]() | Recoverin | ||||||
![]() | METAL BINDING PROTEIN / Recoverin / EF-hand / helix-loop-helix / calcium binding | ||||||
機能・相同性 | ![]() Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade / regulation of calcium ion transport / phototransduction / photoreceptor outer segment / visual perception / photoreceptor inner segment / perikaryon / calcium ion binding / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Weiergraber, O.H. / Granzin, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Tuning of a neuronal calcium sensor. 著者: Weiergraber, O.H. / Senin, I.I. / Zernii, E.Y. / Churumova, V.A. / Kovaleva, N.A. / Nazipova, A.A. / Permyakov, S.E. / Permyakov, E.A. / Philippov, P.P. / Granzin, J. / Koch, K.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 141.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 111.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 457.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 509.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 33.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 39.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1omrS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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5 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21748.322 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-CA / |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.45 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.71 % |
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結晶化 | 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: 2.4 M sodium malonate, 2 mM calcium chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2006年2月25日 / 詳細: Monochromators, mirrors |
放射 | モノクロメーター: Diamond, germanium / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.934 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3→70 Å / Num. all: 14380 / Num. obs: 14380 / % possible obs: 84.8 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.4 % / Biso Wilson estimate: 89.4 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.044 / Rsym value: 0.044 / Net I/σ(I): 11.3 |
反射 シェル | 解像度: 3→3.16 Å / 冗長度: 2.2 % / Rmerge(I) obs: 0.234 / Mean I/σ(I) obs: 1.7 / Num. unique all: 2072 / Rsym value: 0.234 / % possible all: 84.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1OMR 解像度: 3→70 Å / Isotropic thermal model: Isotropic / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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原子変位パラメータ | Biso mean: 77.4 Å2
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Refine analyze |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3→70 Å
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拘束条件 |
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