登録情報 データベース : PDB / ID : 2gru 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of 2-deoxy-scyllo-inosose synthase complexed with carbaglucose-6-phosphate, NAD+ and Co2+ 要素2-deoxy-scyllo-inosose synthase 詳細 キーワード LYASE / aminoglycoside / 2-deoxystreptamine / dehydroquinate synthase機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
2-deoxy-scyllo-inosose synthase / 3-dehydroquinate synthase activity / aromatic amino acid family biosynthetic process / antibiotic biosynthetic process / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 3-dehydroquinate synthase family / 3-dehydroquinate synthase domain / 3-dehydroquinate synthase / Dehydroquinate synthase-like, alpha domain / Dehydroquinate synthase-like - alpha domain / Rossmann fold - #1970 / Up-down Bundle / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-CAK / : / Chem-EXO / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / PHOSPHATE ION / SULFITE ION / 2-deoxy-scyllo-inosose synthase 類似検索 - 構成要素生物種 Bacillus circulans (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.15 Å 詳細データ登録者 Nango, E. / Kumasaka, T. 引用ジャーナル : Proteins / 年 : 2008タイトル : Structure of 2-deoxy-scyllo-inosose synthase, a key enzyme in the biosynthesis of 2-deoxystreptamine-containing aminoglycoside antibiotics, in complex with a mechanism-based inhibitor and NAD+著者 : Nango, E. / Kumasaka, T. / Hirayama, T. / Tanaka, N. / Eguchi, T. 履歴 登録 2006年4月25日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2007年5月8日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2008年4月22日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2023年10月25日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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