+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2gi9 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Backbone Conformational Constraints in a Microcrystalline U-15N-Labeled Protein by 3D Dipolar-Shift Solid-State NMR Spectroscopy | ||||||
![]() | Immunoglobulin B1 binding domain of protein G | ||||||
![]() | IMMUNE SYSTEM / Protein binding / GB1 | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Franks, W.T. / Wylie, B.J. / Stellfox, S.A. / Rienstra, C.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Backbone Conformational Constraints in a Microcrystalline U-15N-Labeled Protein by 3D Dipolar-Shift Solid-State NMR Spectroscopy 著者: Franks, W.T. / Wylie, B.J. / Stellfox, S.A. / Rienstra, C.M. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 24.4 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 15.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 426.7 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 426.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
---|---|
類似構造データ |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
単位格子 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6228.809 Da / 分子数: 1 / 変異: T2Q / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: spg / 発現宿主: ![]() ![]() |
---|---|
#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.92 Å3/Da / 溶媒含有率: 36 % |
---|---|
結晶化 | pH: 4.5 詳細: 5mM Acetate 3.8, 150mM NaCl, 50% MPD and 20% IPA, pH 4.5 |
-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
---|---|
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2005年11月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9791 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.14→50 Å / Num. obs: 16662 / % possible obs: 96.3 % / Observed criterion σ(I): 0 |
-
解析
ソフトウェア |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: AB INITIO / 解像度: 1.14→50 Å / Num. parameters: 3 / Num. restraintsaints: 1803 / 交差検証法: FREE R / σ(F): 4 / 立体化学のターゲット値: ENGH AND HUBER
| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Num. disordered residues: 0 / Occupancy sum hydrogen: 0 / Occupancy sum non hydrogen: 557 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.14→50 Å
| |||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 1 |