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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2f0o | ||||||
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タイトル | Crystal structure of Staphylococcal nuclease mutant V66I/I72V | ||||||
![]() | Staphylococcal nuclease | ||||||
![]() | HYDROLASE / DNA HYDROLASE / RNA HYDROLASE / ENDONUCLEASE / CALCIUM / SIGNAL | ||||||
機能・相同性 | ![]() endonuclease activity, active with either ribo- or deoxyribonucleic acids and producing 3'-phosphomonoesters / micrococcal nuclease / nucleic acid binding / extracellular region / membrane / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Lu, J.Z. / Sakon, J. / Stites, W.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Hydrophobic core mutants of Staphylococcal nuclease 著者: Lu, J.Z. / Sakon, J. / Stites, W.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 39.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 27.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 2f0dC ![]() 2f0eC ![]() 2f0fC ![]() 2f0gC ![]() 2f0hC ![]() 2f0iC ![]() 2f0jC ![]() 2f0kC ![]() 2f0lC ![]() 2f0mC ![]() 2f0nC ![]() 2f0pC ![]() 2f0qC ![]() 2f0sC ![]() 2f0tC ![]() 2f0uC ![]() 2f0vC ![]() 2f0wC ![]() 4h7bC ![]() 4i65C ![]() 4k8iC ![]() 4k8jC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16843.330 Da / 分子数: 1 / 変異: V66I/I72V / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: nuc / プラスミド: pL13 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.1 Å3/Da / 溶媒含有率: 44 % |
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 50mM phosphate buffer, 45% MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→8 Å / Num. all: 10449 / Num. obs: 10449 / Observed criterion σ(I): 0 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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Refine analyze | Num. disordered residues: 7 / Occupancy sum hydrogen: 1 / Occupancy sum non hydrogen: 1122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→8 Å
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拘束条件 |
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