[English] 日本語
Yorodumi- PDB-2eph: Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from Plasmodi... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2eph | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from Plasmodium falciparum in complex with TRAP-tail determined at 2.7 angstrom resolution | ||||||
Components |
| ||||||
Keywords | LYASE / Aldolase / Invasion machinery / Plasmodium falciparum / Structural Genomics / PSI / Protein Structure Initiative / Structural Genomics of Pathogenic Protozoa Consortium / SGPP | ||||||
Function / homology | Function and homology information fructose-bisphosphate aldolase / fructose-bisphosphate aldolase activity / glycolytic process / actin binding / host cell plasma membrane / membrane / plasma membrane / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Plasmodium falciparum (malaria parasite P. falciparum) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.7 Å | ||||||
Authors | Bosch, J. / Buscaglia, C.A. / Krumm, B. / Cardozo, T. / Nussenzweig, V. / Hol, W.G.J. / Structural Genomics of Pathogenic Protozoa Consortium (SGPP) | ||||||
Citation | Journal: Proc.Natl.Acad.Sci.Usa / Year: 2007 Title: Aldolase provides an unusual binding site for thrombospondin-related anonymous protein in the invasion machinery of the malaria parasite. Authors: Bosch, J. / Buscaglia, C.A. / Krumm, B. / Ingason, B.P. / Lucas, R. / Roach, C. / Cardozo, T. / Nussenzweig, V. / Hol, W.G. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 2eph.cif.gz | 283.1 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb2eph.ent.gz | 230.6 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 2eph.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 2eph_validation.pdf.gz | 464.6 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 2eph_full_validation.pdf.gz | 497.9 KB | Display | |
Data in XML | 2eph_validation.xml.gz | 53.6 KB | Display | |
Data in CIF | 2eph_validation.cif.gz | 74.9 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ep/2eph ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ep/2eph | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 2pc4C 1a5cS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
---|---|
Similar structure data | |
Other databases |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: 1 / Refine code: 3
|