A: Similarity to vacuolar protein sorting-associated protein VPS9 B: Small GTP-binding protein-like C: Similarity to vacuolar protein sorting-associated protein VPS9 D: Small GTP-binding protein-like ヘテロ分子
解像度: 2.1→2.18 Å / 冗長度: 1.5 % / Rmerge(I) obs: 0.277 / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / % possible all: 70.9
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.2.0005
精密化
HKL-2000
データ収集
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
MOLREP
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: nucloetide-free Ara7/AtVps9a which was solved by MAD 解像度: 2.1→68.36 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.94 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.916 / SU B: 5.726 / SU ML: 0.155 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / σ(I): 0 / ESU R: 0.282 / ESU R Free: 0.218 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.259
2374
5 %
RANDOM
Rwork
0.21369
-
-
-
obs
0.21599
44747
92.79 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK