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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2e4i | ||||||||||||||||||
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タイトル | Human Telomeric DNA mixed-parallel/antiparallel quadruplex under Physiological Ionic Conditions Stabilized by Proper Incorporation of 8-Bromoguanosines | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / telomere / quadruplex / mixed-parallel/antiparallel | 機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ![]() Matsugami, A. / Xu, Y. / Noguchi, Y. / Sugiyama, H. / Katahira, M. | ![]() ![]() タイトル: Structure of a human telomeric DNA sequence stabilized by 8-bromoguanosine substitutions, as determined by NMR in a K+ solution 著者: Matsugami, A. / Xu, Y. / Noguchi, Y. / Sugiyama, H. / Katahira, M. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 21.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 15.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 251.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 251.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 2.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 7377.977 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Human Telomeric DNA |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 110mM Potassium Ion / pH: 6.3 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: the structures are based on a total of 752 restraints, 582 are NOE-derived distance constraints, 110 dihedral angle restraints,48 distance restraints from hydrogen bonds, 12 planarity ...詳細: the structures are based on a total of 752 restraints, 582 are NOE-derived distance constraints, 110 dihedral angle restraints,48 distance restraints from hydrogen bonds, 12 planarity restraints for tetrad planes. | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |