登録情報 | データベース: PDB / ID: 2.0E+21 |
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タイトル | Crystal structure of TilS in a complex with AMPPNP from Aquifex aeolicus. |
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要素 | tRNA(Ile)-lysidine synthase |
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キーワード | LIGASE / Rossmann-fold / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNAIle-lysidine synthase / ligase activity, forming carbon-nitrogen bonds / tRNA modification / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Chorismate Mutase Domain, subunit A - #20 / tRNA(Ile)-lysidine synthase / tRNA(Ile)-lysidine synthase, N-terminal / tRNA(Ile)-lysidine/2-thiocytidine synthase, N-terminal / PP-loop family / Chorismate Mutase Domain, subunit A / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Up-down Bundle / Rossmann fold ...Chorismate Mutase Domain, subunit A - #20 / tRNA(Ile)-lysidine synthase / tRNA(Ile)-lysidine synthase, N-terminal / tRNA(Ile)-lysidine/2-thiocytidine synthase, N-terminal / PP-loop family / Chorismate Mutase Domain, subunit A / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Up-down Bundle / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER / tRNA(Ile)-lysidine synthase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Aquifex aeolicus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.7 Å |
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データ登録者 | Kuratani, M. / Yoshikawa, Y. / Sekine, S. / Ishii, T. / Shibata, R. / Bessho, Y. / Yokoyama, S. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
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引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Structural basis of the initial binding of tRNA(Ile) lysidine synthetase TilS with ATP and L-lysine 著者: Kuratani, M. / Yoshikawa, Y. / Bessho, Y. / Higashijima, K. / Ishii, T. / Shibata, R. / Takahashi, S. / Yutani, K. / Yokoyama, S. |
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履歴 | 登録 | 2006年11月6日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2007年11月6日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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