登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ddm |
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タイトル | Crystal Structure of Pyridoxal Kinase from the Escherichia coli PdxK gene at 2.1 A resolution |
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要素 | Pyridoxine kinase |
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キーワード | TRANSFERASE / pyridoxal kinase / ribokinase / pyridoxal 5'-phosphate / vitamin B6 / phosphorylation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
thiamine salvage / hydroxymethylpyrimidine kinase activity / pyridoxal kinase activity / pyridoxal 5'-phosphate salvage / pyridoxal kinase / pyridoxal phosphate binding / phosphorylation / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / zinc ion binding ...thiamine salvage / hydroxymethylpyrimidine kinase activity / pyridoxal kinase activity / pyridoxal 5'-phosphate salvage / pyridoxal kinase / pyridoxal phosphate binding / phosphorylation / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / zinc ion binding / ATP binding / cytosol類似検索 - 分子機能 Pyridoxine/pyridoxal/pyridoxamine kinase / Pyridoxine kinase / Pyridoxamine kinase/Phosphomethylpyrimidine kinase / Phosphomethylpyrimidine kinase / Ribokinase / Ribokinase-like / UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
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データ登録者 | Safo, M.K. / Musayev, F.N. / di Salvo, M.L. / Hunt, S. / Claude, J.B. / Schirch, V. |
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引用 | ジャーナル: J.Bacteriol. / 年: 2006 タイトル: Crystal structure of pyridoxal kinase from the Escherichia coli pdxK gene: implications for the classification of pyridoxal kinases. 著者: Safo, M.K. / Musayev, F.N. / di Salvo, M.L. / Hunt, S. / Claude, J.B. / Schirch, V. |
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履歴 | 登録 | 2006年2月2日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2006年8月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月11日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.name |
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改定 1.4 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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