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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2bna | ||||||||||||||||||
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タイトル | STRUCTURE OF A B-DNA DODECAMER AT 16 KELVIN | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / B-DNA / DOUBLE HELIX | 機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | ![]() ![]() Drew, H.R. / Samson, S. / Dickerson, R.E. | ![]() ![]() タイトル: Structure of a B-DNA dodecamer at 16 K. 著者: Drew, H.R. / Samson, S. / Dickerson, R.E. #1: ![]() タイトル: Kinematic Model for B-DNA 著者: Dickerson, R.E. / Drew, H.R. #2: ![]() タイトル: Structure of a B-DNA Dodecamer. Conformation and Dynamics 著者: Drew, H.R. / Wing, R.M. / Takano, T. / Broka, C. / Tanaka, S. / Itakura, K. / Dickerson, R.E. #3: ![]() タイトル: Structure of a B-DNA Dodecamer. II. Influence of Base Sequence on Helix Structure 著者: Dickerson, R.E. / Drew, H.R. #4: ![]() タイトル: Structure of a B-DNA Dodecamer. III. Geometry of Hydration 著者: Drew, H.R. / Dickerson, R.E. #5: ![]() タイトル: Crystal Structure Analysis of a Complete Turn of B-DNA 著者: Wing, R. / Drew, H.R. / Takano, T. / Broka, C. / Tanaka, S. / Itakura, K. / Dickerson, R.E. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 23.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 15.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 349.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 356.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3663.392 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 50 % | ||||||||||||
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結晶化 | 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: VAPOR DIFFUSION, temperature 290.00K | ||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 50 % | ||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: unknown | ||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 16 K |
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検出器 | 検出器: DIFFRACTOMETER |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.7→15 Å / Num. obs: 1824 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / 最低解像度: 15 Å |
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解析
ソフトウェア | 名称: JACK-LEVITT / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.7→15 Å / σ(I): 2 /
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Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→15 Å
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / 最低解像度: 15 Å / Num. reflection all: 1836 / σ(I): 2 / Rfactor all: 0.21 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |