登録情報 データベース : PDB / ID : 2bfg 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル crystal structure of beta-xylosidase (fam GH39) in complex with dinitrophenyl-beta-xyloside and covalently bound xyloside 要素BETA-XYLOSIDASE 詳細 キーワード HYDROLASE / FAMILY GH39 / THERMOPHILIC ENZYME機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
xylan 1,4-beta-xylosidase / xylan 1,4-beta-xylosidase activity / xylan catabolic process 類似検索 - 分子機能 Glycosyl hydrolase domain; family 39 / : / : / Glycosyl hydrolases family 39 active site. / Glycoside hydrolase, family 39 / Glycosyl hydrolases family 39 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel ... Glycosyl hydrolase domain; family 39 / : / : / Glycosyl hydrolases family 39 active site. / Glycoside hydrolase, family 39 / Glycosyl hydrolases family 39 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 2,5-DINITROPHENOL / beta-D-xylopyranose / alpha-D-xylopyranose / Beta-xylosidase 類似検索 - 構成要素生物種 BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.4 Å 詳細データ登録者 Czjzek, M. / Bravman, T. / Henrissat, B. / Shoham, Y. 引用 残り1件を表示 表示を減らす#1: ジャーナル : Acta Crystallogr.,Sect.D / 年 : 2004タイトル : Crystallization and Preliminary X-Ray Analysis of Family 39 Beta-D-Xylosidase from Geobacillus Stearothermophilus T-6
著者 :
Czjzek, M. / Bravman, T. / Henrissat, B. / Shoham, Y. 履歴 登録 2004年12月7日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2005年10月12日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Advisory / Refinement description / Version format compliance改定 1.2 2012年11月14日 Group : Database references / Derived calculations ... Database references / Derived calculations / Other / Refinement description 改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Other / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ... _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年12月13日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_sheet Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ... _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_sheet.number_strands
すべて表示 表示を減らす Remark 700 SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AB, BC, CB" IN EACH CHAIN ON SHEET ... SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AB, BC, CB" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW ARE ACTUALLY 8-STRANDED BARRELS REPRESENTED BY 9-STRANDED SHEETS IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "DB, EC, FB, GB, HB" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW ARE ACTUALLY 7-STRANDED BARRELS THIS IS REPRESENTED BY 8-STRANDED SHEETS IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL.