登録情報 | データベース: PDB / ID: 2b3j |
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タイトル | Crystal Structure of Staphylococcus aureus tRNA Adenosine Deaminase, TadA, in Complex with RNA |
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要素 | - anticodon stem-loop of t-RNA-Arg2 (nucleotides 27-42)
- tRNA adenosine deaminase
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キーワード | HYDROLASE/RNA / mixed alpha-beta / protein-rna complex / RNA stem-loop / HYDROLASE-RNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNA(adenine34) deaminase / tRNA wobble adenosine to inosine editing / tRNA-specific adenosine-34 deaminase activity / zinc ion binding類似検索 - 分子機能 MafB19-like deaminase / tRNA-specific adenosine deaminase / Cytidine Deaminase, domain 2 / Cytidine Deaminase; domain 2 / APOBEC/CMP deaminase, zinc-binding / Cytidine and deoxycytidylate deaminases zinc-binding region signature. / Cytidine and deoxycytidylate deaminase domain / Cytidine and deoxycytidylate deaminases domain profile. / Cytidine deaminase-like / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 RNA / RNA (> 10) / tRNA-specific adenosine deaminase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 (黄色ブドウ球菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Losey, H.C. / Ruthenburg, A.J. / Verdine, G.L. |
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引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2006 タイトル: Crystal structure of Staphylococcus aureus tRNA adenosine deaminase TadA in complex with RNA. 著者: Losey, H.C. / Ruthenburg, A.J. / Verdine, G.L. |
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履歴 | 登録 | 2005年9月20日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2006年1月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年5月1日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2024年2月14日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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