PDB-2aen: Crystal structure of the rotavirus strain DS-1 VP8* core

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2aen

タイトル

Crystal structure of the rotavirus strain DS-1 VP8* core

要素

Outer capsid protein VP4, VP8* core

キーワード

VIRAL PROTEIN / Rotavirus / VP4 / VP8* / Neutralization antigen / Spike protein

機能・相同性

機能・相同性情報

host cell rough endoplasmic reticulum / permeabilization of host organelle membrane involved in viral entry into host cell / host cytoskeleton / viral outer capsid / host cell endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Human rotavirus A (ウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.604 Å

データ登録者

Monnier, N. / Higo-Moriguchi, K. / Sun, Z.-Y.J. / Prasad, B.V.V. / Taniguchi, K. / Dormitzer, P.R.

引用

ジャーナル: J.Virol. / 年: 2006
タイトル: High-resolution molecular and antigen structure of the VP8* core of a sialic acid-independent human rotavirus strain
著者: Monnier, N. / Higo-Moriguchi, K. / Sun, Z.-Y.J. / Prasad, B.V.V. / Taniguchi, K. / Dormitzer, P.R.

履歴

登録	2005年7月22日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2006年2月7日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2008年4月30日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年7月13日	Group: Non-polymer description / Version format compliance
改定 1.3	2017年12月20日	Group: Database references / カテゴリ: pdbx_database_related
改定 1.4	2019年7月24日	Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.name / _software.version
改定 1.5	2023年8月23日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2aen.cif.gz	315.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2aen.ent.gz	255.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2aen.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ae/2aen ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ae/2aen	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1kqrS 1kri S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3mq9-2 4lkg-d 3mq9-1 5813 5igq-d 21645 1nhc-d 2rfo-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#13 - 2001年1月アルコール脱水素酵素 (Alcohol Dehydrogenase) 類似性 (1) #191 - 2015年11月グルタミン酸開閉型塩化物イオン受容体 (Glutamate-gated Chloride Receptors) 類似性 (1) #233 - 2019年5月 S-ニトロシル化ヘモグロビン (S-Nitrosylated Hemoglobin) 類似性 (1) #44 - 2003年8月カルモジュリン (Calmodulin) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#13 - 2001年1月
アルコール脱水素酵素 (Alcohol Dehydrogenase)
類似性 (1)
#191 - 2015年11月
グルタミン酸開閉型塩化物イオン受容体 (Glutamate-gated Chloride Receptors)
類似性 (1)
#233 - 2019年5月
S-ニトロシル化ヘモグロビン (S-Nitrosylated Hemoglobin)
類似性 (1)
#44 - 2003年8月
カルモジュリン (Calmodulin)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Outer capsid protein VP4, VP8* core

B: Outer capsid protein VP4, VP8* core

C: Outer capsid protein VP4, VP8* core

D: Outer capsid protein VP4, VP8* core

E: Outer capsid protein VP4, VP8* core

F: Outer capsid protein VP4, VP8* core

G: Outer capsid protein VP4, VP8* core

H: Outer capsid protein VP4, VP8* core

ヘテロ分子

151 kDa, 8 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	42.421, 84.123, 90.769
Angle α, β, γ (deg.)	90.03, 90.02, 75.54
Int Tables number	1
Cell setting	triclinic
Space group name H-M	P1

#1: タンパク質	Outer capsid protein VP4, VP8* core / Hemagglutinin / Outer capsid protein VP4 [Contains: tryptic fragment VP8* / tryptic fragment VP5] 分子量: 18776.646 Da / 分子数: 8 / 断片: VP8 core, residues 60-223 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Human rotavirus A (ウイルス) / 生物種: Rotavirus A / 株: DS-1 / 遺伝子: GENOME SEGEMENT 4 / Variant: SEROTYPE 2 / プラスミド: pGEX_DS-1_VP8_60_223 / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 DE3 / 参照: GenBank: 75270083, UniProt: P11196*PLUS
#2: 化合物	ChemComp-EOH / ETHANOL / エタノ-ル分子量: 46.068 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1724 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 1.72 Å³/Da / 溶媒含有率: 38.5 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.6 詳細: PEG 4000, sodium chloride, sodium citrate, ethanol, tris, EDTA, sodium azide, benzamidine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: CHESS / ビームライン: F1 / 波長: 0.916 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2003年2月13日 / 詳細: Mirrors
放射	モノクロメーター: Horizontal Bent Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.916 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.6→14.88 Å / Num. all: 153466 / Num. obs: 153466 / % possible obs: 96.8 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 1.95 % / B_iso Wilson estimate: 19.1 Å² / R_sym value: 0.05 / Net I/σ(I): 17.2
反射シェル	解像度: 1.6→1.66 Å / 冗長度: 1.72 % / Mean I/σ(I) obs: 3.4 / Num. unique all: 15018 / R_sym value: 0.376 / % possible all: 94.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2	精密化
SCALEPACK		データスケーリング
CNS		精密化
HKL-2000		データ収集
HKL-2000		データ削減
CNS		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB Entry 1KQR

1kqr

解像度: 1.604→14.88 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.972 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.96 / SU B: 3.263 / SU ML: 0.06 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.093 / ESU R Free: 0.092 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: ATOM RECORDS CONTAIN THE SUM OF TLS AND RESIDUAL B FACTORS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.19173	7761	5.1 %	RANDOM
R_work	0.1579	-	-	-
all	0.15961	145697	-	-
obs	0.15961	145697	100 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 24.907 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.35 Å²	-0.06 Å²	0.07 Å²
2-	-	-0.13 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.2 Å²

Refine analyze

	Free	Obs
Luzzati coordinate error	0.21 Å	0.19 Å
Luzzati d res low	-	5 Å
Luzzati sigma a	0.15 Å	0.14 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.604→14.88 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10616	0	48	1724	12388

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.011	0.022	11089
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.002	0.02	9308
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.31	1.919	15077
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.506	3	21835
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.684	5	1310
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.543	24.876	605
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	11.706	15	1786
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	7.243	15	56
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.084	0.2	1596
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.005	0.02	12455
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	2313
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.192	0.2	1715
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.185	0.2	9152
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.182	0.2	5270
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.084	0.2	6441
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.139	0.2	1155
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.165	0.2	44
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.205	0.2	285
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.151	0.2	112
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.794	1.5	8490
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.177	1.5	2668
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.019	2	10781
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.789	3	5390
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	2.495	4.5	4295

LS精密化シェル

解像度: 1.604→1.645 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.241	549	-
R_work	0.192	10013	-
obs	-	-	100 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.5595	0.3934	1.4293	6.538	0.3188	2.858	0.1524	-0.2695	-0.3406	0.1238	-0.0138	0.1807	0.3269	-0.1347	-0.1386	-0.1792	0.0033	-0.0387	-0.1632	0.0383	-0.1919	10.2862	12.2007	21.9078
2	1.2135	-0.3365	-0.2008	9.5038	3.2725	2.4836	0.0188	-0.0798	-0.1991	0.0041	-0.1925	0.555	0.1715	-0.3331	0.1737	-0.2059	-0.0055	-0.0247	-0.1464	0.0168	-0.1641	-0.0238	18.0227	16.9393
3	3.2243	-1.8943	1.0189	3.2085	-0.4034	2.0817	-0.0217	-0.2016	0.1808	-0.0345	0.0265	-0.1063	-0.219	-0.1912	-0.0048	-0.188	0.0051	-0.0091	-0.1756	0.0042	-0.1885	-3.9591	30.9555	13.0294
4	2.1667	-0.3809	0.1875	1.147	0.2403	1.1934	0.0055	-0.0124	0.1206	-0.0572	0.0058	-0.0902	-0.02	0.1609	-0.0113	-0.1895	-0.0078	-0.0032	-0.1686	0.0074	-0.1953	15.2325	24.432	16.0823
5	4.5189	1.5009	1.6945	8.2057	-0.2918	1.4814	0.1498	-0.2614	-0.3946	0.037	0.0106	0.3584	0.3505	-0.1064	-0.1604	-0.1281	-0.0186	-0.0457	-0.1518	0.0592	-0.1577	44.0787	-28.4391	21.1789
6	2.2207	-0.1064	-0.3052	8.2409	3.1215	2.5551	0.1002	-0.214	-0.3583	0.1001	-0.1661	0.4961	0.2267	-0.3638	0.0659	-0.1929	-0.0311	-0.0348	-0.1375	0.0508	-0.1156	33.6974	-22.7578	16.0972
7	2.1047	-1.0153	-0.0493	1.9074	-0.1865	1.4783	0.0412	-0.1034	-0.0213	-0.0603	0.0166	0.0755	-0.0101	-0.1888	-0.0578	-0.1931	-0.0045	-0.0176	-0.1561	0.0166	-0.1867	29.5991	-10.0201	12.3445
8	1.718	-0.7042	-0.0183	1.2446	0.3123	1.521	0.0508	-0.1364	0.0362	0.0795	0.0146	-0.1312	0.0302	0.1644	-0.0654	-0.1882	-0.0136	-0.0071	-0.1734	-0.0028	-0.1652	48.8955	-16.0254	15.5923
9	7.1344	-0.1192	-0.5274	3.7515	-1.5003	3.0937	-0.0559	0.2477	0.0302	-0.6271	0.2246	0.4236	0.287	-0.4687	-0.1687	0.0344	-0.0656	-0.0944	-0.0906	0.0473	-0.1518	25.1816	47.684	33.8919
10	8.7226	-2.1281	-2.4065	3.1338	1.7219	2.9665	-0.246	0.0763	-0.414	-0.3897	0.0714	0.3878	0.3428	-0.3576	0.1747	-0.0347	-0.0544	-0.0383	-0.1449	0.0061	-0.1554	28.9161	36.577	39.2087
11	0.3603	-1.2073	-0.1325	4.0459	0.388	3.2378	-0.0889	-0.0674	-0.1413	-0.3339	0.2143	-0.1149	0.1826	0.07	-0.1254	-0.1368	-0.0436	0.0089	-0.1456	-0.007	-0.1758	40.6595	30.32	43.3079
12	0.6005	0.7127	-0.1934	3.4831	-0.0151	0.6013	-0.1532	0.0933	0.0387	-0.5874	0.1994	-0.1805	-0.0625	-0.0415	-0.0462	-0.0568	-0.0429	0.0334	-0.1381	-0.0157	-0.1772	38.1536	50.2931	39.6032
13	7.3298	0.2541	0.3218	4.3267	-1.2311	2.654	-0.0571	-0.1477	-0.1338	-0.1184	0.0843	0.4218	0.0688	-0.3138	-0.0273	-0.1678	0.0152	-0.0546	-0.1768	0.0163	-0.1971	14.8663	8.5292	34.4816
14	7.2342	-1.7847	-1.964	2.9137	1.3228	2.2293	-0.1264	0.0323	-0.3903	-0.0847	-0.0313	0.4116	0.2739	-0.3153	0.1576	-0.1531	-0.0012	-0.0225	-0.1583	0.0173	-0.1676	17.4948	-3.2474	39.0574
15	0.535	-0.4654	0.6635	3.2334	-0.6013	0.823	-0.0533	-0.0034	-0.0877	-0.1037	0.049	-0.0842	0.1305	-0.0012	0.0043	-0.1872	0.0236	0.0139	-0.1698	0.0211	-0.1857	28.8183	-10.981	42.2707
16	0.4899	-0.5046	-0.182	2.7902	0.0381	1.5569	-0.0304	-0.0532	0.0722	-0.0981	0.0197	-0.2181	-0.1866	0.1058	0.0106	-0.1848	-0.0006	-0.0049	-0.1595	0.0006	-0.1842	28.341	9.4026	39.6929
17	6.8561	0.6974	-0.1495	4.094	1.1402	2.9116	-0.061	-0.1167	0.1444	-0.1356	0.0768	-0.4285	-0.0817	0.2813	-0.0158	-0.1581	0.019	0.0546	-0.1805	-0.0218	-0.195	-0.735	34.8592	79.8586
18	7.4248	-2.061	2.5878	3.0748	-1.3775	2.8645	-0.1041	0.0392	0.4123	-0.079	-0.0387	-0.4255	-0.2743	0.3514	0.1428	-0.1533	-0.0037	0.0226	-0.1571	-0.0222	-0.161	-3.3528	46.6384	84.4347
19	0.4482	-0.2462	-0.7184	3.653	0.9602	1.2424	-0.083	-0.0296	0.1266	-0.1041	0.068	0.0474	-0.1914	-0.0005	0.0151	-0.1887	0.0266	-0.0133	-0.1547	-0.0272	-0.1878	-14.5399	54.3211	87.7637
20	0.5471	-0.6148	0.1943	2.8172	0.0757	1.6566	-0.0288	-0.055	-0.0829	-0.0928	0.0246	0.2051	0.1768	-0.1069	0.0043	-0.185	-0.0006	0.0014	-0.1584	-0.0021	-0.1831	-14.1984	33.9798	85.0721
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31	3.1759	-2.3325	-0.648	2.5645	0.4747	2.2153	-0.0305	-0.1406	-0.1478	-0.0433	0.0231	0.0354	0.1882	0.2333	0.0074	-0.1925	0.0092	0.0031	-0.1809	-0.0021	-0.183	18.1825	12.6936	58.3055
32	2.2365	-0.406	-0.1735	1.0965	-0.361	1.2975	0.0037	-0.0202	-0.1325	-0.0583	0.0037	0.0955	0.0153	-0.1651	-0.0074	-0.1924	-0.0086	-0.0026	-0.1736	-0.0118	-0.1969	-1.0681	18.9779	61.4638

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	167 - 176	108 - 117
2	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	185 - 194	126 - 135
3	X-RAY DIFFRACTION	2	A	A	139 - 157	80 - 98
4	X-RAY DIFFRACTION	2	A	A	96 - 105	37 - 46
5	X-RAY DIFFRACTION	3	A	A	111 - 135	52 - 76
6	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	60 - 95	1 - 36
7	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	106 - 110	47 - 51
8	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	136 - 138	77 - 79
9	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	158 - 166	99 - 107
10	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	177 - 184	118 - 125
11	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	195 - 223	136 - 164
12	X-RAY DIFFRACTION	5	B	B	167 - 176	108 - 117
13	X-RAY DIFFRACTION	5	B	B	185 - 194	126 - 135
14	X-RAY DIFFRACTION	6	B	B	139 - 157	80 - 98
15	X-RAY DIFFRACTION	6	B	B	96 - 105	37 - 46
16	X-RAY DIFFRACTION	7	B	B	111 - 135	52 - 76
17	X-RAY DIFFRACTION	8	B	B	60 - 95	1 - 36
18	X-RAY DIFFRACTION	8	B	B	106 - 110	47 - 51
19	X-RAY DIFFRACTION	8	B	B	136 - 138	77 - 79
20	X-RAY DIFFRACTION	8	B	B	158 - 166	99 - 107
21	X-RAY DIFFRACTION	8	B	B	177 - 184	118 - 125
22	X-RAY DIFFRACTION	8	B	B	195 - 223	136 - 164
23	X-RAY DIFFRACTION	9	C	C	167 - 176	108 - 117
24	X-RAY DIFFRACTION	9	C	C	185 - 194	126 - 135
25	X-RAY DIFFRACTION	10	C	C	139 - 157	80 - 98
26	X-RAY DIFFRACTION	10	C	C	96 - 105	37 - 46
27	X-RAY DIFFRACTION	11	C	C	111 - 135	52 - 76
28	X-RAY DIFFRACTION	12	C	C	60 - 95	1 - 36
29	X-RAY DIFFRACTION	12	C	C	106 - 110	47 - 51
30	X-RAY DIFFRACTION	12	C	C	136 - 138	77 - 79
31	X-RAY DIFFRACTION	12	C	C	158 - 166	99 - 107
32	X-RAY DIFFRACTION	12	C	C	177 - 184	118 - 125
33	X-RAY DIFFRACTION	12	C	C	195 - 223	136 - 164
34	X-RAY DIFFRACTION	13	D	D	167 - 176	108 - 117
35	X-RAY DIFFRACTION	13	D	D	185 - 194	126 - 135
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45	X-RAY DIFFRACTION	17	E	E	167 - 176	108 - 117
46	X-RAY DIFFRACTION	17	E	E	185 - 194	126 - 135
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49	X-RAY DIFFRACTION	19	E	E	111 - 135	52 - 76
50	X-RAY DIFFRACTION	20	E	E	60 - 95	1 - 36
51	X-RAY DIFFRACTION	20	E	E	106 - 110	47 - 51
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54	X-RAY DIFFRACTION	20	E	E	177 - 184	118 - 125
55	X-RAY DIFFRACTION	20	E	E	195 - 223	136 - 164
56	X-RAY DIFFRACTION	21	F	F	167 - 176	108 - 117
57	X-RAY DIFFRACTION	21	F	F	185 - 194	126 - 135
58	X-RAY DIFFRACTION	22	F	F	139 - 157	80 - 98
59	X-RAY DIFFRACTION	22	F	F	96 - 105	37 - 46
60	X-RAY DIFFRACTION	23	F	F	111 - 135	52 - 76
61	X-RAY DIFFRACTION	24	F	F	60 - 95	1 - 36
62	X-RAY DIFFRACTION	24	F	F	106 - 110	47 - 51
63	X-RAY DIFFRACTION	24	F	F	136 - 138	77 - 79
64	X-RAY DIFFRACTION	24	F	F	158 - 166	99 - 107
65	X-RAY DIFFRACTION	24	F	F	177 - 184	118 - 125
66	X-RAY DIFFRACTION	24	F	F	195 - 223	136 - 164
67	X-RAY DIFFRACTION	25	G	G	167 - 176	108 - 117
68	X-RAY DIFFRACTION	25	G	G	185 - 194	126 - 135
69	X-RAY DIFFRACTION	26	G	G	139 - 157	80 - 98
70	X-RAY DIFFRACTION	26	G	G	96 - 105	37 - 46
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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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