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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2a9x | ||||||
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タイトル | TAR RNA recognition by a cyclic peptidomimetic of Tat protein | ||||||
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![]() | RNA binding protein/RNA / NMR / peptidomimetics / peptide structure / RNA recognition / immunodeficiency virus / TAR RNA / RNA binding protein-RNA COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | RNA / RNA (> 10)![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / Torsion Angle Molecular Dynamics | ||||||
![]() | Leeper, T.C. / Athanassiou, Z. / Dias, R.L. / Robinson, J.A. / Varani, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: TAR RNA recognition by a cyclic peptidomimetic of Tat protein. 著者: Leeper, T.C. / Athanassiou, Z. / Dias, R.L. / Robinson, J.A. / Varani, G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 218.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 189.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 375.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 550.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 34.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 47.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 8923.310 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: RNA was transcribed in vitro from DNA oligonucleotide templates with T7 RNA polymerase purified in house with unlabeled or 13C/15N enriched NTPs (Silantes) and purified by denaturing PAGE. |
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#2: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1754.162 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: The BIV-2 peptide was synthesized by solid phase synthesis and purified by reverse phase HPLC |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Torsion Angle Molecular Dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |