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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2a13 | ||||||
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タイトル | X-ray structure of protein from Arabidopsis thaliana AT1G79260 | ||||||
![]() | At1g79260 | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / AT1G79260 / PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE / PSI / CENTER FOR EUKARYOTIC STRUCTURAL GENOMICS / CESG | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Wesenberg, G.E. / Phillips Jr., G.N. / McCoy, J.G. / Bitto, E. / Bingman, C.A. / Allard, S.T.M. / Center for Eukaryotic Structural Genomics (CESG) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The structure and NO binding properties of the nitrophorin-like heme-binding protein from Arabidopsis thaliana gene locus At1g79260.1. 著者: Bianchetti, C.M. / Blouin, G.C. / Bitto, E. / Olson, J.S. / Phillips, G.N. | ||||||
履歴 |
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Remark 300 | BIOMOLECULE: 1 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 1 CHAIN(S) ...BIOMOLECULE: 1 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 1 CHAIN(S). SEE REMARK 350 FOR INFORMATION ON GENERATING A POSSIBLE BIOLOGICAL DIMER. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 88 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 67.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 416.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 417.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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詳細 | POSSIBLE DIMER ALONG A TWO-FOLD SPACE GOURP SYMMETRY AXIS |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18557.629 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: AT1G79260 / プラスミド: PVP-16 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 |
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 10 MG/ML PROTEIN, 18% PEG2K, 0.025 M TRIS, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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Reflection | D res low: 50 Å
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Diffraction reflection shell |
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反射 | 解像度: 1.31→50 Å / Num. obs: 41019 / % possible obs: 96.3 % / 冗長度: 7.5 % / Rmerge(I) obs: 0.066 / Χ2: 1.169 / Net I/σ(I): 14.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 1.31→1.34 Å / % possible obs: 93.1 % / 冗長度: 6.8 % / Rmerge(I) obs: 0.24 / Mean I/σ(I) obs: 6.178 / Num. measured obs: 2588 / Χ2: 1.043 / % possible all: 93.1 |
-位相決定
位相決定 | 手法: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Phasing MAD set | 最高解像度: 1.46 Å / 最低解像度: 32.86 Å
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Phasing MAD set shell |
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