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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 255d | ||||||||||||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF AN RNA DOUBLE HELIX INCORPORATING A TRACK OF NON-WATSON-CRICK BASE PAIRS | ||||||||||||||||||
![]() | RNA (5'-R(*![]() RNA / A-RNA / DOUBLE HELIX / MISMATCHED | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 手法 | ![]() ![]() Holbrook, S.R. / Cheong, C. / Tinoco Jr, I. / Kim, S.-H. | ![]() ![]() タイトル: Crystal structure of an RNA double helix incorporating a track of non-Watson-Crick base pairs. 著者: Holbrook, S.R. / Cheong, C. / Tinoco Jr., I. / Kim, S.H. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 17.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 9.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 335.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 344.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 3804.296 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.43 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.3 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法 / pH: 8.5 / 詳細: pH 8.50, VAPOR DIFFUSION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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-データ収集
回折 | Ambient temp details: ROOM TEMPERATURE |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU AFC-5 / 検出器: DIFFRACTOMETER |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2 Å / Num. obs: 2280 |
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解析
ソフトウェア | 名称: NUCLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 1 /
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Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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