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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1zjo | ||||||
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タイトル | Crystal Structure of Human N-acetylgalactosaminyltransferase (GTA) Complexed with Galactose-grease | ||||||
![]() | Histo-blood group ABO system transferase (NAGAT) Includes: Glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N- acetylgalactosaminyltransferase | ||||||
![]() | TRANSFERASE / GTA / ABO(H) / Blood group / H-antigen / glycosyltransferase / retaining | ||||||
機能・相同性 | ![]() fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase / glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase / glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase activity / fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase activity / ABO blood group biosynthesis / lipid glycosylation / Golgi cisterna membrane / protein glycosylation / antigen binding / manganese ion binding ...fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase / glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase / glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase activity / fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase activity / ABO blood group biosynthesis / lipid glycosylation / Golgi cisterna membrane / protein glycosylation / antigen binding / manganese ion binding / vesicle / carbohydrate metabolic process / Golgi membrane / nucleotide binding / Golgi apparatus / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Letts, J.A. / Rose, N.L. / Fang, Y.R. / Barry, C.H. / Borisova, S.N. / Seto, N.O. / Palcic, M.M. / Evans, S.V. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Differential Recognition of the Type I and II H Antigen Acceptors by the Human ABO(H) Blood Group A and B Glycosyltransferases. 著者: Letts, J.A. / Rose, N.L. / Fang, Y.R. / Barry, C.H. / Borisova, S.N. / Seto, N.O. / Palcic, M.M. / Evans, S.V. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 77.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 55.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 15.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1zhjC ![]() 1zi1C ![]() 1zi3C ![]() 1zi4C ![]() 1zi5C ![]() 1zizC ![]() 1zj0C ![]() 1zj1C ![]() 1zj2C ![]() 1zj3C ![]() 1zjpC ![]() 2a8uC ![]() 2a8wC ![]() 1lz0S C: 同じ文献を引用 ( S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
-タンパク質 / 糖 , 2種, 2分子 A![](data/chem/img/DR4.gif)
![](data/chem/img/DR4.gif)
#1: タンパク質 | 分子量: 34194.496 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: P16442, glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase |
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#5: 糖 | ChemComp-DR4 / |
-非ポリマー , 5種, 243分子 ![](data/chem/img/HG.gif)
![](data/chem/img/CL.gif)
![](data/chem/img/MN.gif)
![](data/chem/img/UDP.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/CL.gif)
![](data/chem/img/MN.gif)
![](data/chem/img/UDP.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#2: 化合物 | ChemComp-HG / #3: 化合物 | #4: 化合物 | ChemComp-MN / | #6: 化合物 | ChemComp-UDP / | #7: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.28 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.1 % |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 113 K |
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検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2005年4月14日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1LZ0 解像度: 1.64→20 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.64→20 Å
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