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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1z30 | ||||||||||||||||||
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タイトル | NMR structure of the apical part of stemloop D from cloverleaf 1 of bovine enterovirus 1 RNA | ||||||||||||||||||
![]() | 5'-R(*![]() RNA / cGUUAg RNA tetraloop / cUNCGg-type backbone conformation / A-form helix | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / distance geometry, simulated annealing, energy minimisation | ![]() Ihle, Y. / Ohlenschlager, O. / Duchardt, E. / Ramachandran, R. / Gorlach, M. | ![]() ![]() タイトル: A novel cGUUAg tetraloop structure with a conserved yYNMGg-type backbone conformation from cloverleaf 1 of bovine enterovirus 1 RNA 著者: Ihle, Y. / Ohlenschlager, O. / Hafner, S. / Duchardt, E. / Zacharias, M. / Seitz, S. / Zell, R. / Ramachandran, R. / Gorlach, M. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 167.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 140.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 318.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 401.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 5765.451 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: The sequence of this RNA naturally exist in bovine enterovirus 1 (Virus) |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry, simulated annealing, energy minimisation ソフトェア番号: 1 詳細: 518 upper limit distance constraints derived from NOE cross peaks, 184 torsion angle constraints defining 156 torsion angles, 36 hydrogen bond constraints | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy, target function 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |