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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1yha | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURES OF Y41H AND Y41F MUTANTS OF GENE V PROTEIN FROM FF PHAGE SUGGEST POSSIBLE PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS IN GVP-SSDNA COMPLEX | ||||||
![]() | GENE V PROTEIN | ||||||
![]() | DNA BINDING PROTEIN / DNA-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() rolling circle single-stranded viral DNA replication / single-stranded DNA binding / DNA replication 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Guan, Y. / Zhang, H. / Konings, R.N.H. / Hilbers, C.W. / Terwilliger, T.C. / Wang, A.H.-J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of Y41H and Y41F mutants of gene V protein from Ff phage suggest possible protein-protein interactions in the GVP-ssDNA complex. 著者: Guan, Y. / Zhang, H. / Konings, R.N. / Hilbers, C.W. / Terwilliger, T.C. / Wang, A.H. #1: ![]() タイトル: Structure of the Gene V Protein of Bacteriophage F1 Determined by Multiwavelength X-Ray Diffraction on the Selenomethionyl Protein 著者: Skinner, M.M. / Zhang, H. / Leschnitzer, D.H. / Guan, Y. / Bellamy, H. / Sweet, R.M. / Gray, C.W. / Konings, R.N.H. / Wang, A.H.-J. / Terwilliger, T.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 44 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 31.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 373.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 384.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: VAL A 84 - PRO A 85 OMEGA =147.29 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9674.188 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 属: Inovirus / 生物種: Enterobacteria phage M13 / 参照: UniProt: P69543 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.77 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.5 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / Num. obs: 3983 / % possible obs: 85 % / Observed criterion σ(F): 3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→8 Å / σ(F): 3 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.17 / Rfactor Rwork: 0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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