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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1yat | ||||||
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タイトル | IMPROVED CALCINEURIN INHIBITION BY YEAST FKBP12-DRUG COMPLEXES. CRYSTALLOGRAPHIC AND FUNCTIONAL ANALYSIS | ||||||
![]() | FK506 BINDING PROTEIN | ||||||
![]() | BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() Calcineurin activates NFAT / regulation of homoserine biosynthetic process / macrolide binding / mTORC1-mediated signalling / peptidylprolyl isomerase / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / protein folding / chromatin organization / mitochondrion / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Rotonda, J. / Becker, J.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Improved calcineurin inhibition by yeast FKBP12-drug complexes. Crystallographic and functional analysis. 著者: Rotonda, J. / Burbaum, J.J. / Chan, H.K. / Marcy, A.I. / Becker, J.W. #1: ![]() タイトル: Fk-506-Binding Protein: Three-Dimensional Structure of the Complex with the Antagonist L-685,818 著者: Becker, J.W. / Rotonda, J. / Mckeever, B.M. / Chan, H.K. / Marcy, A.I. / Wiederrecht, G. / Hermes, J.D. / Springer, J.P. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE ...SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SIX-STRANDED SHEETS ARE DEFINED. STRANDS 1, 2, 3, 4, AND 5 ARE IDENTICAL IN BOTH SHEETS WHILE STRAND 6 IS DIFFERENT. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 35.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 23.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 838.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 843.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12038.628 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P20081 |
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#2: 化合物 | ChemComp-FK5 / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.11 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.09 % | ||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 8.75 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / Num. obs: 6822 / % possible obs: 98 % / Num. measured all: 57469 / Rmerge(I) obs: 0.0977 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→8 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. reflection all: 6822 / σ(F): 0 / Rfactor all: 0.177 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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