ソフトウェア | 名称 | 分類 |
---|
DENZO | データ削減 | SCALEPACK | データスケーリング | ULTIMA | モデル構築 | SHELXL-97 | 精密化 | ULTIMA | 位相決定 |
|
---|
精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: FIBER A-DNA 解像度: 2→15 Å / Num. parameters: 1696 / Num. restraintsaints: 5755 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 立体化学のターゲット値: L.CLOWNEY ET AL.,J.AM.CHEM.SOC.118(1996)509-518, A.GELBIN ET AL.,J.AM.CHEM.SOC.118(1996)519-529, G.PARKINSON ET AL.,ACTA CRYST.D52(1996)57-64 詳細: ANISOTROPIC SCALING APPLIED BY THE METHOD OF PARKIN, MOEZZI & HOPE, J.APPL.CRYST.28(1995)53-56
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
---|
Rfree | 0.1884 | 146 | 5 % | RANDOM |
---|
Rwork | 0.1407 | - | - | - |
---|
all | 0.1418 | 2931 | - | - |
---|
obs | 0.1418 | - | 97.2 % | - |
---|
|
---|
Refine analyze | Num. disordered residues: 0 / Occupancy sum hydrogen: 0 / Occupancy sum non hydrogen: 420 |
---|
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→15 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
---|
原子数 | 0 | 330 | 0 | 90 | 420 |
---|
|
---|
拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
---|
X-RAY DIFFRACTION | s_bond_d0.007 | X-RAY DIFFRACTION | s_angle_d0.024 | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_dist0.021 | X-RAY DIFFRACTION | s_from_restr_planes0.0005 | X-RAY DIFFRACTION | s_zero_chiral_vol0 | X-RAY DIFFRACTION | s_non_zero_chiral_vol0.006 | X-RAY DIFFRACTION | s_anti_bump_dis_restr0.007 | X-RAY DIFFRACTION | s_rigid_bond_adp_cmpnt0 | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_adp_cmpnt0.112 | X-RAY DIFFRACTION | s_approx_iso_adps0 | | | | | | | | | | |
|
---|