登録情報 | データベース: PDB / ID: 1xey |
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タイトル | Crystal structure of the complex of Escherichia coli GADA with glutarate at 2.05 A resolution |
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要素 | Glutamate decarboxylase alpha |
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キーワード | LYASE / GLUTAMATE DECARBOXYLASE / COMPLEX WITH GLUTARATE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
glutamate decarboxylase / glutamate decarboxylase activity / intracellular pH elevation / glutamate catabolic process / pyridoxal phosphate binding / membrane / cytosol類似検索 - 分子機能 MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B - #50 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 - #160 / Glutamate decarboxylase / Pyridoxal-phosphate binding site / DDC / GAD / HDC / TyrDC pyridoxal-phosphate attachment site. / MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B / Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase / Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 ...MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B - #50 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 - #160 / Glutamate decarboxylase / Pyridoxal-phosphate binding site / DDC / GAD / HDC / TyrDC pyridoxal-phosphate attachment site. / MYOD Basic-Helix-Loop-Helix Domain, subunit B / Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase / Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Few Secondary Structures / Irregular / Alpha-Beta Complex / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / GLUTARIC ACID / PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE / Glutamate decarboxylase alpha類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.05 Å |
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データ登録者 | Dutyshev, D.I. / Darii, E.L. / Fomenkova, N.P. / Pechik, I.V. / Polyakov, K.M. / Nikonov, S.V. / Andreeva, N.S. / Sukhareva, B.S. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 2005 タイトル: Structure of Escherichia coli glutamate decarboxylase (GADalpha) in complex with glutarate at 2.05 angstroms resolution. 著者: Dutyshev, D.I. / Darii, E.L. / Fomenkova, N.P. / Pechik, I.V. / Polyakov, K.M. / Nikonov, S.V. / Andreeva, N.S. / Sukhareva, B.S. |
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履歴 | 登録 | 2004年9月13日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2004年10月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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