登録情報 | データベース: PDB / ID: 1wwr |
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タイトル | Crystal structure of tRNA adenosine deaminase TadA from Aquifex aeolicus |
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要素 | tRNA adenosine deaminase TadA |
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キーワード | HYDROLASE / homodimer / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative / RSGI / Structural Genomics |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNA-specific adenosine-34 deaminase complex / tRNA(adenine34) deaminase / tRNA wobble adenosine to inosine editing / tRNA-specific adenosine-34 deaminase activity / zinc ion binding類似検索 - 分子機能 MafB19-like deaminase / tRNA-specific adenosine deaminase / Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region / Cytidine Deaminase, domain 2 / Cytidine Deaminase; domain 2 / APOBEC/CMP deaminase, zinc-binding / Cytidine and deoxycytidylate deaminases zinc-binding region signature. / Cytidine and deoxycytidylate deaminase domain / Cytidine and deoxycytidylate deaminases domain profile. / Cytidine deaminase-like ...MafB19-like deaminase / tRNA-specific adenosine deaminase / Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region / Cytidine Deaminase, domain 2 / Cytidine Deaminase; domain 2 / APOBEC/CMP deaminase, zinc-binding / Cytidine and deoxycytidylate deaminases zinc-binding region signature. / Cytidine and deoxycytidylate deaminase domain / Cytidine and deoxycytidylate deaminases domain profile. / Cytidine deaminase-like / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Aquifex aeolicus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.8 Å |
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データ登録者 | Kuratani, M. / Ishii, R. / Bessho, Y. / Fukunaga, R. / Sengoku, T. / Sekine, S. / Yokoyama, S. / RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2005 タイトル: Crystal Structure of tRNA Adenosine Deaminase (TadA) from Aquifex aeolicus 著者: Kuratani, M. / Ishii, R. / Bessho, Y. / Fukunaga, R. / Sengoku, T. / Shirouzu, M. / Sekine, S. / Yokoyama, S. |
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履歴 | 登録 | 2005年1月12日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2005年2月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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