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- PDB-1wce: Crystal structure of the T13 IBDV viral particle reveals a missin... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1wce | ||||||
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Title | Crystal structure of the T13 IBDV viral particle reveals a missing link in icosahedral viruses evolution | ||||||
![]() | MAJOR STRUCTURAL PROTEIN VP2 | ||||||
![]() | VIRUS / NON-ENVELOPED ICOSAHEDRAL VIRUSES / DOUBLE-STRANDED RNA VIRUS PROTEIN / BIRNAVIRUS / TRANSCRIPTASE MACHINERY / HYDROLASE / MEMBRANE TRANSLOCATION ACTIVITY / EVOLUTION / ICOSAHEDRAL VIRUS | ||||||
Function / homology | ![]() T=13 icosahedral viral capsid / Hydrolases; Acting on peptide bonds (peptidases); Serine endopeptidases / serine-type peptidase activity / host cell cytoplasm / structural molecule activity / proteolysis / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
Model type details | CA ATOMS ONLY, CHAIN A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M | ||||||
![]() | Coulibaly, F. / Chevalier, C. / Gutsche, I. / Pous, J. / Bressanelli, S. / Navaza, J. / Delmas, B. / Rey, F.A. | ||||||
![]() | ![]() Title: The Birnavirus Crystal Structure Reveals Structural Relationships Among Icosahedral Viruses. Authors: Coulibaly, F. / Chevalier, C. / Gutsche, I. / Pous, J. / Navaza, J. / Bressanelli, S. / Delmas, B. / Rey, F.A. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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PDBx/mmCIF format | ![]() | 176.8 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 127.5 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 387.4 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 387.6 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 1.7 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 48.3 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 1wcdSC S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
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3 | ![]()
| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | ![]()
| x 6|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | ![]()
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6 | ![]()
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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