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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1vxc | ||||||
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タイトル | NATIVE SPERM WHALE MYOGLOBIN | ||||||
![]() | MYOGLOBIN | ||||||
![]() | OXYGEN STORAGE / SPERM WHALE MYOGLOBIN / PH VALUES / CONFORMATIONAL CHANGES | ||||||
機能・相同性 | ![]() nitrite reductase activity / 酸化還元酵素; 他の含窒素化合物が電子供与する / sarcoplasm / 酸化還元酵素; 過酸化物を電子受容体にする; ペルオキシダーゼ / removal of superoxide radicals / oxygen carrier activity / oxygen binding / peroxidase activity / heme binding / extracellular exosome / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Yang, F. / Phillips Jr., G.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of CO-, deoxy- and met-myoglobins at various pH values. 著者: Yang, F. / Phillips Jr., G.N. #1: ![]() タイトル: X-Ray Structure and Refinement of Carbon-Monoxy (Fe II)-Myoglobin at 1.5 A Resolution 著者: Kuriyan, J. / Wilz, S. / Karplus, M. / Petsko, G.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 47.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 32.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 828 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 831.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17234.951 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: PH 5.0, 4 DEGREES CELSIUS / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-HEM / |
#4: 化合物 | ChemComp-CMO / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.94 Å3/Da / 溶媒含有率: 36.5 % |
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結晶化 | pH: 5 / 詳細: pH 5.0 |
結晶化 | *PLUS 手法: batch method |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 75 %sat / 一般名: ammonium salfate |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: SIEMENS-NICOLET X100 / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1992年12月31日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→30 Å / Num. obs: 15401 / Observed criterion σ(I): 0 / Rmerge(I) obs: 0.056 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→5 Å / σ(F): 0 / 詳細: TERMINAL RESIDUES 151 - 153 ARE DISORDERED.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→5 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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