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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1utg | ||||||
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タイトル | REFINEMENT OF THE C2221 CRYSTAL FORM OF OXIDIZED UTEROGLOBIN AT 1.34 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | UTEROGLOBIN | ||||||
![]() | STEROID BINDING | ||||||
機能・相同性 | ![]() phospholipase A2 inhibitor activity / steroid binding / signal transduction / extracellular space / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Morize, I. / Surcouf, E. / Vaney, M.C. / Buehner, M. / Mornon, J.P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Refinement of the C222(1) crystal form of oxidized uteroglobin at 1.34 A resolution. 著者: Morize, I. / Surcouf, E. / Vaney, M.C. / Epelboin, Y. / Buehner, M. / Fridlansky, F. / Milgrom, E. / Mornon, J.P. #1: ![]() タイトル: Evidence for the Identity of Anti-Proteinase Pulmonary Protein Ccsp and Uteroglobin 著者: Lopez Deharo, M.S. / Alvarez, L. / Nieto, A. #2: ![]() タイトル: Purification, Characterization and Proteinase-Inhibitory Activity of a Clara-Cell Secretory Protein from the Pulmonary Extracellular Lining of Rabbits 著者: Gupta, R.P. / Patton, S.E. / Jetten, A.M. / Hook, G.E.R. #3: ![]() タイトル: Uteroglobin. Structure, Molecular Biology, and New Perspectives on its Function as a Phospholipasea2 Inhibitor 著者: Miele, L. / Cordella-Miele, E. / Mukherjee, A.B. #4: ![]() タイトル: Use of Molecular Replacement in the Structure Determination of the P21212 and the P21 (Pseudo P21212) Crystal Forms of Oxidized Uteroglobin 著者: Buehner, M. / Lifchitz, A. / Bally, R. / Mornon, J.P. #5: ![]() タイトル: X-Ray Crystallographic Analysis of a Progesterone-Binding Protein. The C 2 2 21 Crystal Form of Oxidized Uteroglobin at 2.2 Angstroms Resolution 著者: Mornon, J.P. / Fridlansky, F. / Bally, R. / Milgrom, E. #6: ![]() タイトル: Characterization of Two New Crystal Forms of Uteroglobin 著者: Mornon, J.P. / Bally, R. / Fridlansky, F. / Milgrom, E. #7: ![]() タイトル: X-Ray Analysis of a Progesterone-Binding Protein (Uteroglobin). Preliminary Results 著者: Mornon, J.P. / Surcouf, E. / Bally, R. / Fridlansky, F. / Milgrom, E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 23.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 17.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: SEE REMARK 5. | ||||||||
Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7910.272 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
構成要素の詳細 | THE SECONDARY STRUCTURE CONSISTS OF FOUR ALPHA-HELICES AND ONE BETA-TURN PER MONOMER. A CAVITY ...THE SECONDARY STRUCTURE CONSISTS OF FOUR ALPHA-HELICES AND ONE BETA-TURN PER MONOMER. A CAVITY EXISTS IN THE DIMER, BETWEEN THE TWO MONOMERS. ITS LENGTH IS 15.6 ANGSTROMS AND ITS WIDTH IS 9. ANGSTROMS. 14 WATER MOLECULES POSITIONS COULD BE RECOGNISED |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.98 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.97 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: took from Mornon et al., from original paper | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.34 Å / 最低解像度: 22 Å / Num. obs: 7509 / Rmerge(I) obs: 0.089 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.23 / 最高解像度: 1.34 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.34 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 5 Å / Num. reflection obs: 14227 / Rfactor obs: 0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |