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Yorodumi- PDB-1utd: The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) b... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1utd | ||||||
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Title | The structure of the trp RNA-binding attenuation protein (TRAP) bound to a 63-nucleotide RNA molecule containing GAGUUU repeats | ||||||
Components |
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Keywords | RNA BINDING PROTEIN / TRANSCRIPTION REGULATION / RNA-BINDING / TRP RNA TRANSCRIPTION ATTENUATION / RNA-BINDING PROTEIN | ||||||
Function / homology | Function and homology information DNA-templated transcription termination / regulation of DNA-templated transcription / RNA binding / identical protein binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS (bacteria) synthetic construct (others) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.1 Å | ||||||
Authors | Hopcroft, N.H. / Manfredo, A. / Wendt, A.L. / Brzozowski, A.M. / Gollnick, P. / Antson, A.A. | ||||||
Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2004 Title: The Interaction of RNA with Trap: The Role of Triplet Repeats and Separating Spacer Nucleotides Authors: Hopcroft, N.H. / Manfredo, A. / Wendt, A.L. / Brzozowski, A.M. / Gollnick, P. / Antson, A.A. #1: Journal: Acta Crystallogr.,Sect.D / Year: 2002 Title: Specificity of Trap/RNA Interactions: Crystal Structures of Complexes with Two Different RNA Sequences Authors: Hopcroft, N.H. / Wendt, A.L. / Gollnick, P. / Antson, A.A. #2: Journal: Nature / Year: 1999 Title: Structure of the Trp RNA-Binding Attenuation Protein, Trap, Bound to RNA Authors: Antson, A.A. / Dodson, E.J. / Dodson, G.G. / Greaves, R.B. / Chen, X.-P. / Gollnick, P. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1utd.cif.gz | 353.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb1utd.ent.gz | 287.2 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1utd.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ut/1utd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ut/1utd | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 4v4fC 1c9sS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
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