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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1tkq | |||||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF A LINKED UNSYMMETRIC GRAMICIDIN IN A MEMBRANE-ISOELECTRICAL SOLVENTS MIXTURE IN THE PRESENCE OF CsCl | |||||||||
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![]() | ANTIBIOTIC / GRAMICIDIN / ANTIFUNGAL / ANTIBACTERIAL / MEMBRANE ION CHANNEL / LINEAR GRAMICIDIN | |||||||||
機能・相同性 | MINI-GRAMICIDIN A - GRAMICIDIN A DIMER / SUCCINIC ACID / : ![]() | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | |||||||||
Model type details | MINIMIZED AVERAGE | |||||||||
![]() | Xie, X. / Al-Momani, L. / Bockelmann, D. / Griesinger, C. / Koert, U. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: An Asymmetric Ion Channel Derived from Gramicidin A. Synthesis, Function and NMR Structure. 著者: Xie, X. / Al-Momani, L. / Reiss, P. / Griesinger, C. / Koert, U. #1: ジャーナル: Science / 年: 1993 タイトル: High-Resolution Conformation of Gramicidin a in a Lipid Bilayer by Solid-State NMR 著者: Ketchem, R.R. / Hu, W. / Cross, T.A. #2: ![]() タイトル: Solution Structure of a Parallel Left-Handed Double-Helical Gramicidin-A Determined by 2D 1H NMR 著者: Chen, Y. / Tucker, A. / Wallace, B.A. #3: ![]() タイトル: Cation Control in Functional Helical Programming: Structures of a D,L-Peptide Ion Channel 著者: Arndt, H.-D. / Bockelmann, D. / Knoll, A. / Lamberth, S. / Griesinger, C. / Koert, U. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 17.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 14.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 368 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 368.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 2.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | |
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#2: タンパク質・ペプチド | |
#3: 化合物 | ChemComp-SIN / |
構成要素の詳細 | GRAMICIDIN IS A HETEROGENEOUS MIXTURE OF SEVERAL COMPOUNDS INCLUDING GRAMICIDIN A, B AND C WHICH ...GRAMICIDIN |
配列の詳細 | BOTH OF THE C-TERMINI HAVE ETHANOLAMINE ATTACHED WITH THE CAPPING GROUP T-BUTYLDIPHENYLSILYL, WHICH ...BOTH OF THE C-TERMINI HAVE ETHANOLAMI |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: VARIABLE TEMPERATURE EXPERIMENTS WERE PERFORMED TO HAVE THE TEMPERATURE DEPENDENCE OF NH CHEMICAL SHIFTS, THEREFORE PROVIDE EVIDENCE FOR HYDROGEN BONDING. |
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試料調製
詳細 | 内容: 3MM SATURATED WITH CSCL |
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試料状態 | 温度: 293 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 800 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURES ARE BASED ON 160 NOE- DERIVED DISTANCE CONSTRAINTS, 39 DIHEDRAL ANGLE RESTRAINTS, AND 40 DISTANCE RESTRAINTS FROM HYDROGEN BONDS | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE OF 11 STRUCTURES WITH THE LOWEST TARGET FUNCTION 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |