登録情報 | データベース: PDB / ID: 1szr |
---|
タイトル | A Dimer interface mutant of ornithine decarboxylase reveals structure of gem diamine intermediate |
---|
要素 | Ornithine decarboxylase |
---|
キーワード | LYASE / pyridoxal phosphate / PXP / ODC / ornithine decarboxylase / gem-diamine / carbinolamine / dimer interface / beta-alpha-barrels / greek key |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
ornithine decarboxylase / putrescine biosynthetic process from ornithine / ornithine decarboxylase activity / polyamine biosynthetic process / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Ornithine decarboxylase / Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, pyridoxal-phosphate binding site / Orn/DAP/Arg decarboxylases family 2 pyridoxal-P attachment site. / Orn/DAP/Arg decarboxylases family 2 signature 2. / Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, C-terminal / Pyridoxal-dependent decarboxylase, C-terminal sheet domain / Ornithine/DAP/Arg decarboxylase / Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, N-terminal / Pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain / Lyase, Ornithine Decarboxylase; Chain A, domain 1 ...Ornithine decarboxylase / Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, pyridoxal-phosphate binding site / Orn/DAP/Arg decarboxylases family 2 pyridoxal-P attachment site. / Orn/DAP/Arg decarboxylases family 2 signature 2. / Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, C-terminal / Pyridoxal-dependent decarboxylase, C-terminal sheet domain / Ornithine/DAP/Arg decarboxylase / Orn/DAP/Arg decarboxylase 2, N-terminal / Pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain / Lyase, Ornithine Decarboxylase; Chain A, domain 1 / Lyase, Ornithine Decarboxylase; Chain A, domain 1 / Alanine racemase / Alanine racemase/group IV decarboxylase, C-terminal / PLP-binding barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Beta Barrel / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-ORX / Chem-PLG / PYRIDOXINE-5'-PHOSPHATE / Ornithine decarboxylase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_eukaryote.gif) Trypanosoma brucei brucei (トリパノソーマ) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.15 Å |
---|
データ登録者 | Jackson, L.K. / Baldwin, J. / Goldsmith, E.J. / Phillips, M.A. |
---|
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2004 タイトル: Multiple active site conformations revealed by distant site mutation in ornithine decarboxylase 著者: Jackson, L.K. / Baldwin, J. / Akella, R. / Goldsmith, E.J. / Phillips, M.A. |
---|
履歴 | 登録 | 2004年4月6日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2004年10月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2008年4月30日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.3 | 2021年10月27日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / struct_conn ...database_2 / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
改定 1.4 | 2023年8月23日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
---|
|
---|