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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1scy | ||||||
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タイトル | DETERMINATION OF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF SCYLLATOXIN BY 1H NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE | ||||||
要素 | SCYLLATOXIN | ||||||
キーワード | NEUROTOXIN | ||||||
機能・相同性 | Scorpion short toxins signature. / Scorpion short chain toxin, potassium channel inhibitor / Scorpion short toxin, BmKK2 / Knottin, scorpion toxin-like superfamily / ion channel inhibitor activity / potassium channel regulator activity / toxin activity / extracellular region / Potassium channel toxin alpha-KTx 5.1 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Leiurus quinquestriatus hebraeus (サソリ) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Martins, J.C. / Van De Ven, F.J.M. / Borremans, F.A.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1995 タイトル: Determination of the three-dimensional solution structure of scyllatoxin by 1H nuclear magnetic resonance. 著者: Martins, J.C. / Van de Ven, F.J. / Borremans, F.A. #1: ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 1990 タイトル: Solution Conformation of Leiurotoxin I (Scyllatoxin) by 1H Nuclear Magnetic Resonance. Resonance Assignment and Secondary Structure 著者: Martins, J.C. / Zhang, W. / Tartar, A. / Lazdunski, M. / Borremans, F.A.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1scy.cif.gz | 237.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1scy.ent.gz | 196.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1scy.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1scy_validation.pdf.gz | 350.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1scy_full_validation.pdf.gz | 447.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1scy_validation.xml.gz | 12 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1scy_validation.cif.gz | 21.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/1scy ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/1scy | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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Atom site foot note | 1: CYS 21 - ILE 22 MODEL 2 OMEGA = 149.70 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 2: ALA 1 - PHE 2 MODEL 6 OMEGA = 211.28 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 3: ASP 24 - LYS 25 MODEL 6 OMEGA = 229.33 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 4: CYS 21 - ILE 22 MODEL 7 OMEGA = 146.08 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 5: ASP 24 - LYS 25 MODEL 8 OMEGA = 230.57 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 6: GLY 19 - LYS 20 MODEL 10 OMEGA = 219.59 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 7: ASP 24 - LYS 25 MODEL 12 OMEGA = 214.95 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 8: LYS 20 - CYS 21 MODEL 16 OMEGA = 213.91 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 9: LYS 20 - CYS 21 MODEL 20 OMEGA = 214.83 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 10: ASP 24 - LYS 25 MODEL 21 OMEGA = 213.51 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 11: ALA 1 - PHE 2 MODEL 22 OMEGA = 228.55 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 12: CYS 3 - ASN 4 MODEL 25 OMEGA = 145.89 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION | |||||||||
NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3434.223 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Leiurus quinquestriatus hebraeus (サソリ) 生物種: Leiurus quinquestriatus / 株: hebraeus / 参照: UniProt: P16341 |
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Has protein modification | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
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-解析
NMR software |
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NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 25 |