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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rfb | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT BOVINE INTERFERON-GAMMA AT 3.0 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | INTERFERON-GAMMA | ||||||
![]() | GLYCOPROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() Interferon gamma signaling / Regulation of IFNG signaling / IFNG signaling activates MAPKs / type II interferon receptor binding / humoral immune response / positive regulation of B cell proliferation / cytokine activity / defense response to virus / adaptive immune response / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Samudzi, C.T. / Rubin, J.R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of recombinant bovine interferon-gamma at 3.0 A resolution. 著者: Samudzi, C.T. / Rubin, J.R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 60 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 46 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: SER B 19 - PRO B 20 OMEGA =279.70 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 2: GLY B 26 - PRO B 27 OMEGA =290.90 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14055.080 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.6 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.63 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 17 ℃ / pH: 6 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.66 Å / Num. obs: 7891 / Num. measured all: 19800 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.192 / Rfactor obs: 0.192 / 最高解像度: 3 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 3 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 3 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. reflection obs: 2744 / σ(I): 2 / Rfactor obs: 0.192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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