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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rci | |||||||||
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タイトル | BULLFROG RED CELL L FERRITIN TARTRATE/MG/PH 5.5 | |||||||||
![]() | L FERRITIN | |||||||||
![]() | IRON STORAGE | |||||||||
機能・相同性 | ![]() intracellular sequestering of iron ion / ferric iron binding / ferrous iron binding / iron ion transport / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Rana catesbeiana (カエル) | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Trikha, J. / Theil, E.C. / Allewell, N.M. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: High resolution crystal structures of amphibian red-cell L ferritin: potential roles for structural plasticity and solvation in function. 著者: Trikha, J. / Theil, E.C. / Allewell, N.M. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Structural Analysis of Bullfrog Red Cell L-Subunit Ferritins 著者: Trikha, J. / Waldo, G.S. / Lewandowski, F.A. / Ha, Y. / Theil, E.C. / Weber, P.C. / Allewell, N.M. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 47.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 34.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 376.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 378.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
| x 24||||||||
単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 132 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19992.359 Da / 分子数: 1 / 変異: H25Y / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rana catesbeiana (カエル) / Cell: RED CELL / 遺伝子: CDNA / プラスミド: PET 3A / 遺伝子 (発現宿主): CDNA / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-BET / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.11 Å3/Da / 溶媒含有率: 60.47 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 5.5 / 詳細: pH 5.5 | ||||||||||||||||||||||||
結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 54 % | ||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 5.4 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
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検出器 | タイプ: NICOLET / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1992年6月15日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2→10 Å / Num. obs: 14234 / % possible obs: 95.5 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.124 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.124 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→10 Å / σ(F): 2 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 7.03 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.15 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |