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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qtr | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE PROLYL AMINOPEPTIDASE FROM SERRATIA MARCESCENS | ||||||
![]() | PROLYL AMINOPEPTIDASE | ||||||
![]() | HYDROLASE / ALPHA BETA HYDROLASE FOLD / PROLINE / PROLYL AMINOPEPTIDASE / SERRATIA / IMINOPEPTIDASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Yoshimoto, T. / Kabashima, T. / Uchikawa, K. / Inoue, T. / Tanaka, N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of prolyl aminopeptidase from Serratia marcescens. 著者: Yoshimoto, T. / Kabashima, T. / Uchikawa, K. / Inoue, T. / Tanaka, N. / Nakamura, K.T. / Tsuru, M. / Ito, K. #1: ![]() タイトル: Prolyl Aminopeptidase from Serratia marcescens : Sequencing and Expression 著者: Kabashima, T. / Kitazono, A. / Kitano, A. / Inoue, K. / Yoshimoto, T. #2: ![]() タイトル: Prolyl aminopeptidase is not a sulfhydryl enzyme: Identification of the active serine residue by site-directed mutagenesis 著者: Kitazono, A. / Ito, K. / Yoshimoto, T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 71.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 54.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 365.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 376.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36130.594 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.5 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.79 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 297 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: PEG6000, SODIUM ACETATE, NA CACODYLATE/KH2PO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K | |||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / 詳細: Kabashima, T., (1997) J.Biochem.(Tokyo), 122, 601. | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1997年10月25日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.32→10 Å / Num. obs: 45646 / % possible obs: 89.1 % / Rmerge(I) obs: 0.059 |
反射 | *PLUS Num. obs: 14917 / Num. measured all: 45646 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.32→8 Å / σ(F): 1
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.32→8 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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