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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qg2 | ||||||
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タイトル | CANINE GDP-RAN R76E MUTANT | ||||||
![]() | PROTEIN (RAN) | ||||||
![]() | GTPASE / NUCLEAR TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() RISC complex binding / pre-miRNA binding / pre-miRNA export from nucleus / nuclear export signal receptor activity / snRNA import into nucleus / GTP metabolic process / RISC complex / mitotic sister chromatid segregation / ribosomal subunit export from nucleus / protein export from nucleus ...RISC complex binding / pre-miRNA binding / pre-miRNA export from nucleus / nuclear export signal receptor activity / snRNA import into nucleus / GTP metabolic process / RISC complex / mitotic sister chromatid segregation / ribosomal subunit export from nucleus / protein export from nucleus / positive regulation of protein export from nucleus / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / protein import into nucleus / melanosome / nuclear envelope / cell division / GTPase activity / GTP binding / magnesium ion binding / protein-containing complex / nucleus / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kent, H.M. / Moore, M.S. / Quimby, B.B. / Baker, A.M.E. / McCoy, A.J. / Murphy, G.A. / Corbett, A.H. / Stewart, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Engineered mutants in the switch II loop of Ran define the contribution made by key residues to the interaction with nuclear transport factor 2 (NTF2) and the role of this interaction ...タイトル: Engineered mutants in the switch II loop of Ran define the contribution made by key residues to the interaction with nuclear transport factor 2 (NTF2) and the role of this interaction in nuclear protein import. 著者: Kent, H.M. / Moore, M.S. / Quimby, B.B. / Baker, A.M. / McCoy, A.J. / Murphy, G.A. / Corbett, A.H. / Stewart, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 55 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 39.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 453.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 456.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24428.023 Da / 分子数: 1 / 断片: ALL / 変異: R76E / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 解説: CDNA OBTAINED BY SITE-SPECIFIC MUTAGENESIS OF WILD-TYPE CANINE RAN CDNA AS DESCRIBED IN PUBLIC 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 化合物 | ChemComp-GDP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.25 Å3/Da / 溶媒含有率: 35.8 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7.2 / 詳細: SEE PUBLICATION, pH 7.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 18 ℃ / pH: 8 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1998年6月21日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.033 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→24.112 Å / Num. obs: 9871 / % possible obs: 95.5 % / 冗長度: 8.4 % / Rmerge(I) obs: 0.066 / Rsym value: 0.066 / Net I/σ(I): 9.4 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.42 Å / 冗長度: 7.1 % / Rmerge(I) obs: 0.343 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / Rsym value: 0.343 / % possible all: 91.9 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / % possible obs: 95.5 % / 冗長度: 2.5 % |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / 最低解像度: 2.42 Å / % possible obs: 91.9 % / 冗長度: 7.1 % / Mean I/σ(I) obs: 2.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: EBI-1279 解像度: 2.5→6 Å / σ(F): 0
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→6 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: REFMAC / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 6 Å / Num. reflection obs: 9825 / Rfactor obs: 0.198 / Rfactor Rfree: 0.246 / Rfactor Rwork: 0.198 | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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