最高解像度: 1.5 Å / 最低解像度: 1.58 Å / % possible obs: 98.4 % / 冗長度: 3.9 % / Rmerge(I) obs: 0.095 / Mean I/σ(I) obs: 7.7
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.1.19
精密化
MOSFLM
データ削減
CCP4
(SCALA)
データスケーリング
SOLVE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 多重同系置換 / 解像度: 1.5→30 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.954 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.949 / SU B: 0.96 / SU ML: 0.038 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / ESU R: 0.071 / ESU R Free: 0.066 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: THE THERMAL DISPLACEMENT PARAMETERS OF CHAIN A REFLECT THE RESIDUAL B FACTOR AND DOES NOT INCLUDE THE TLS CORRECTION.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.17508
3386
5 %
RANDOM
Rwork
0.16499
-
-
-
obs
0.1655
64231
98.23 %
-
all
-
64231
-
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 4.176 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
-0.34 Å2
0 Å2
0 Å2
2-
-
0.07 Å2
0 Å2
3-
-
-
0.27 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.5→30 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
3442
0
29
366
3837
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.006
0.021
3538
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_other_d
0.002
0.02
2981
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.078
1.936
4778
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_other_deg
0.73
3
6986
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
6.285
5
439
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.07
0.2
516
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.004
0.02
3982
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_other
0.002
0.02
705
X-RAY DIFFRACTION
r_nbd_refined
0.197
0.2
597
X-RAY DIFFRACTION
r_nbd_other
0.236
0.2
3520
X-RAY DIFFRACTION
r_nbtor_other
0.08
0.2
1910
X-RAY DIFFRACTION
r_xyhbond_nbd_refined
0.085
0.2
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_vdw_refined
0.135
0.2
18
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_vdw_other
0.252
0.2
46
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_hbond_refined
0.117
0.2
21
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_it
0.291
1.5
2178
X-RAY DIFFRACTION
r_mcangle_it
0.567
2
3505
X-RAY DIFFRACTION
r_scbond_it
1.059
3
1360
X-RAY DIFFRACTION
r_scangle_it
1.656
4.5
1273
LS精密化 シェル
解像度: 1.5→1.581 Å / Total num. of bins used: 10 /
Rfactor
反射数
Rfree
0.167
497
Rwork
0.158
9237
obs
-
9734
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: 44.2858 Å / Origin y: 29.8237 Å / Origin z: 15.2957 Å