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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ohj | ||||||
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タイトル | HUMAN DIHYDROFOLATE REDUCTASE, MONOCLINIC (P21) CRYSTAL FORM | ||||||
![]() | DIHYDROFOLATE REDUCTASE | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of removal of superoxide radicals / tetrahydrobiopterin biosynthetic process / Metabolism of folate and pterines / tetrahydrofolate metabolic process / response to methotrexate / sequence-specific mRNA binding / folic acid binding / axon regeneration / dihydrofolate metabolic process / G1/S-Specific Transcription ...regulation of removal of superoxide radicals / tetrahydrobiopterin biosynthetic process / Metabolism of folate and pterines / tetrahydrofolate metabolic process / response to methotrexate / sequence-specific mRNA binding / folic acid binding / axon regeneration / dihydrofolate metabolic process / G1/S-Specific Transcription / dihydrofolate reductase / dihydrofolate reductase activity / folic acid metabolic process / NADPH binding / tetrahydrofolate biosynthetic process / Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation / one-carbon metabolic process / mRNA regulatory element binding translation repressor activity / NADP binding / negative regulation of translation / mRNA binding / mitochondrion / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Cody, V. / Galitsky, N. / Luft, J.R. / Pangborn, W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Comparison of two independent crystal structures of human dihydrofolate reductase ternary complexes reduced with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate and the very tight-binding inhibitor PT523. 著者: Cody, V. / Galitsky, N. / Luft, J.R. / Pangborn, W. / Rosowsky, A. / Blakley, R.L. #1: ![]() タイトル: Methotrexate-Resistant Variants of Human Dihydrofolate Reductase with Substitutions of Leucine 22. Kinetics, Crystallography, and Potential as Selectable Markers 著者: Lewis, W.S. / Cody, V. / Galitsky, N. / Luft, J.R. / Pangborn, W. / Chunduru, S.K. / Spencer, H.T. / Appleman, J.R. / Blakley, R.L. #2: ![]() タイトル: Methotrexate-Resistant Variants of Human Dihydrofolate Reductase. Effects of Phe31 Substitutions 著者: Chunduru, S.K. / Cody, V. / Luft, J.R. / Pangborn, W. / Appleman, J.R. / Blakley, R.L. #3: ![]() タイトル: Crystal Structure Determination at 2.3 A of Recombinant Human Dihydrofolate Reductase Ternary Complex with Nadph and Methotrexate-Gamma-Tetrazole 著者: Cody, V. / Luft, J.R. / Ciszak, E. / Kalman, T.I. / Freisheim, J.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 53.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 38.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 584.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 614.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21349.525 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: COMPLEXED WITH NADPH AND PT523 NA-(4-AMINO-4-DEOXYPTEROYL)-ND-HEMIPHTHALOYL-L-ORNITHINE 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-NDP / |
#3: 化合物 | ChemComp-COP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.54 Å3/Da / 溶媒含有率: 48 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→8 Å / Num. obs: 5276 / % possible obs: 93.4 % / Observed criterion σ(I): 2 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROFFT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.5→8 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.208 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 16.86 Å2 |