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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ocw | ||||||
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タイトル | Free conformation Ab2 of the IgE SPE-7 | ||||||
![]() | (IMMUNOGLOBULIN E) x 2 | ||||||
![]() | IMMUNE SYSTEM / ANTIBODY / ALLERGY / CONFORMATIONAL DIVERSITY / MULTISPECIFICITY | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | James, L.C. / Roversi, P. / Tawfik, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Antibody Multispecificity Mediated by Conformational Diversity 著者: James, L.C. / Roversi, P. / Tawfik, D. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN ... SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 58.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 43.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 410.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 439.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: 抗体 | 分子量: 13616.237 Da / 分子数: 1 / 断片: FV REGION, RESIDUES 1-121 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 抗体 | 分子量: 12584.981 Da / 分子数: 1 / 断片: FV REGION, RESIDUES 1-120 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
Has protein modification | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.5 Å3/Da / 溶媒含有率: 40 % |
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結晶化 | pH: 5 / 詳細: 0.1M HEPES, PH7.5, 70% MPD, pH 5.00 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2002年8月15日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: NI FILTER / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.01→28.17 Å / Num. obs: 13952 / % possible obs: 94.4 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 9.9 % / Rmerge(I) obs: 0.051 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1OAQ 解像度: 2→28.17 Å 詳細: REFINEMENT OF TWINNING FRACTION: ALPHA=0.50(05). REFINEMENT WITH IDEALISED HYDROGEN ATOMS TWINNED DATA; APPARENT SYMMETRY I422; TWINNING OPERATOR
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→28.17 Å
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精密化 | *PLUS Rfactor all: 0.21 / Rfactor obs: 0.252 / Rfactor Rfree: 0.21 | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |