- PDB-1nau: NMR Solution Structure of the Glucagon Antagonist [desHis1, desPh... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 1nau
タイトル
NMR Solution Structure of the Glucagon Antagonist [desHis1, desPhe6, Glu9]Glucagon Amide in the Presence of Perdeuterated Dodecylphosphocholine Micelles
分子量: 3213.495 Da / 分子数: 1 / 変異: DEL(H53), DEL(F58), D7E / 由来タイプ: 合成 詳細: This sequence was chemically synthesized. It was obtained by modifying the sequence of glucagon, which occurs naturally in Homo sapiens (human). 参照: UniProt: P01275
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
DQF-COSY
1
2
1
2D TOCSY
1
3
1
2D NOESY
NMR実験の詳細
Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques.
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試料調製
詳細
内容: 7mM [desHis1, desPhe6, Glu9]Glucagon Amide; 50 mM sodium phosphate buffer; 283 mM dodecylphosphocholine-d38 micelles; 1 mM sodium azide; 90% H2O, 10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料状態
イオン強度: 50 mM sodium phosphate; 1mM sodium azide / pH: 6.0 / 圧: ambient / 温度: 310 K
結晶化
*PLUS
手法: other / 詳細: NMR
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NMR測定
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M
放射波長
相対比: 1
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker AMX / 製造業者: Bruker / モデル: AMX / 磁場強度: 500 MHz
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解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
UXNMR
Bruker
collection
Felix
2000
Accelrys
解析
Felix
2000
Accelrys
データ解析
DGII
withinInsightII2000
Accelrys
構造決定
Discover
withinInsightII2000
Accelrys
精密化
精密化
手法: distance geometry, restrained molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: The structures are based on a total of 486 restraints, 475 are NOE-derived distance restraints, 11 dihedral angle restraints
代表構造
選択基準: minimized average structure
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: 15 structures with the lowest restraint energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 16