登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mgv |
---|
タイトル | Crystal Structure of the R391A Mutant of 7,8-Diaminopelargonic Acid Synthase |
---|
要素 | 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase |
---|
キーワード | TRANSFERASE / Aminotransferase / fold type I / subclass II / homodimer |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate transaminase / adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate transaminase activity / dethiobiotin synthase activity / biotin biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding / protein homodimerization activity / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase BioA / : / Aminotransferases class-III pyridoxal-phosphate attachment site. / Aminotransferase class-III / Aminotransferase class-III / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain ...Adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase BioA / : / Aminotransferases class-III pyridoxal-phosphate attachment site. / Aminotransferase class-III / Aminotransferase class-III / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ISOPROPYL ALCOHOL / PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE / Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å |
---|
データ登録者 | Eliot, A.C. / Sandmark, J. / Schneider, G. / Kirsch, J.F. |
---|
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2002 タイトル: The Dual-Specific Active Site of 7,8-Diaminopelargonic Acid Synthase and the Effect of the R391A Mutation 著者: Eliot, A.C. / Sandmark, J. / Schneider, G. / Kirsch, J.F. |
---|
履歴 | 登録 | 2002年8月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2002年11月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2008年4月28日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
---|
改定 1.3 | 2018年3月7日 | Group: Advisory / Data collection / カテゴリ: diffrn_source / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site |
---|
改定 1.4 | 2021年10月27日 | Group: Advisory / Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / pdbx_struct_conn_angle ...database_2 / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
改定 1.5 | 2024年4月3日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
---|
|
---|
Remark 999 | sequence the authors maintain that residue 14 is a leucine, as confirmed by DNA sequencing. |
---|