NUCLEOTIDES 5(U25), 6(U25), 7(C25), 8(5GP) HAS A NON-STANDARD 2'-5' LINKAGE.
Has protein modification
N
-
実験情報
-
実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
2D NOESY
1
2
1
DQF-COSY
NMR実験の詳細
Text: Structure was determined using standard 2D homo- and heteronuclear techniques: 2D-NOESY, DQF-COSY, TOCSY, H,C-HMQC, H,P-HetCOSY
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試料調製
詳細
内容: 1.5 mM hairpin / 溶媒系: D2O, H2O/D2O
試料状態
pH: 7 / 圧: 1 atm / 温度: 288 K
結晶化
*PLUS
手法: other / 詳細: NMR
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NMR測定
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
相対比: 1
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 500 MHz
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解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR
3.851
Brunger
精密化
X-PLOR
Brunger
データ解析
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: Structures were refined by NMR-restrained molecular dynamics (12 ps, 300-1000 K) with final energy minimization
代表構造
選択基準: closest to the average, lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations,structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 10