+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1m02 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | NMR Structure of PW2 Bound to SDS Micelles: A Tryptophan-rich Anticocidial Peptide Selected from Phage Display Libraries | ||||||
![]() | HIS-PRO-LEU-LYS-GLN-TYR-TRP-TRP-ARG-PRO-SER-ILE | ||||||
![]() | DE NOVO PROTEIN / Anticoccidial peptide / Eimeria / SDS / micelle / antimicrobial / pw2 | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Tinoco, L.W. / da Silva Jr., A. / Leite, A. / Valente, A.P. / Almeida, F.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: NMR structure of PW2 bound to SDS micelles. A tryptophan-rich anticoccidial peptide selected from phage display libraries 著者: Tinoco, L.W. / Da Silva Jr., A. / Leite, A. / Valente, A.P. / Almeida, F.C. #1: ![]() タイトル: Avian anticoccidial activity of a novel membrane-interactive peptide selected from phage display libraries 著者: da Silva Jr., A. / Kawazoe, U. / Freitas, F.F. / Gatti, M.S. / Dolder, H. / Schumacher, R.I. / Juliano, M.A. / da Silva, M.J. / Leite, A. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 77.8 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 55.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 335.8 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 426.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1613.881 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: solid phase synthesis |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 | 内容: 4 mM PW2 溶媒系: 20 mM sodium phosphate buffer, 160 mM SDS-d25, 10% D20 |
---|---|
試料状態 | イオン強度: 100 mM sodium chloride / pH: 5.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
|
-
解析
NMR software |
| ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 / 詳細: cartesian dynamics | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 19 |